32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4164 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4164  hypothetical protein  100 
 
 		 552 aa  1149    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124418  normal  0.0303167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  70.63 
 
 		 795 aa  594  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4136  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  54.78 
 
 		 544 aa  575  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  47.65 
 
 		 569 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6786  hypothetical protein  43.49 
 
 		 707 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  34.96 
 
 		 1010 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1657  hypothetical protein  32.67 
 
 		 473 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3357  hypothetical protein  32.49 
 
 		 423 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0185934 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1345  xylosidase/arabinosidase  32.16 
 
 		 435 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196415  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  59.68 
 
 		 603 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  53.38 
 
 		 409 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  49.03 
 
 		 639 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  50 
 
 		 1115 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  48.03 
 
 		 627 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  45.45 
 
 		 358 aa  87.8  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0282  metallophosphoesterase  33.71 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.94 
 
 		 1357 aa  80.9  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  38.98 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5220  hypothetical protein  31.29 
 
 		 723 aa  77.8  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  32 
 
 		 1176 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4972  Xylan 1,4-beta-xylosidase  38.66 
 
 		 632 aa  74.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122581  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  37.29 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  31.5 
 
 		 542 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  34.45 
 
 		 682 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7478  Xylan 1,4-beta-xylosidase  29.6 
 
 		 635 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.08 
 
 		 734 aa  60.8  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1696  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000261124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6701  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.26 
 
 		 558 aa  47  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3277  hypothetical protein  30.16 
 
 		 182 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3286  hypothetical protein  30.16 
 
 		 182 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3051  hypothetical protein  30.16 
 
 		 182 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.123826  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.91 
 
 		 673 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>