22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1757 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1757  putative lipoprotein  100 
 
 		 501 aa  1042    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2083  hypothetical protein  36.07 
 
 		 580 aa  238  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2042  hypothetical protein  31.63 
 
 		 438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0909871  normal  0.0827276 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  28.44 
 
 		 671 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2345  hypothetical protein  31.4 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.403479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1994  hypothetical protein  31.33 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.192222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1979  hypothetical protein  31.63 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4641  hypothetical protein  28.25 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1659  hypothetical protein  29.46 
 
 		 446 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.828474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4059  hypothetical protein  29.47 
 
 		 446 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157657  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3986  hypothetical protein  29.25 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0282  hypothetical protein  24.74 
 
 		 627 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5739  hypothetical protein  24.32 
 
 		 562 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0282  hypothetical protein  24.69 
 
 		 627 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0434  hypothetical protein  24.7 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0322  hypothetical protein  25 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000309201  normal  0.674626 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2290  hypothetical protein  24.34 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.807993  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1681  hypothetical protein  27.66 
 
 		 571 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158563  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3713  hypothetical protein  29.14 
 
 		 413 aa  54.3  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000844508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0837  hypothetical protein  30.49 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0644  hypothetical protein  22.67 
 
 		 492 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3598  hypothetical protein  22 
 
 		 492 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>