21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0419 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0419  hypothetical protein  100 
 
 		 1129 aa  2327    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3233  WD-40-like repeat-containing protein  24.74 
 
 		 1048 aa  288  5e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5750  surface antigen (D15)  27.22 
 
 		 1072 aa  210  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0248549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3587  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1087 aa  209  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.137997 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  22.98 
 
 		 1078 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  23.88 
 
 		 982 aa  103  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  22.5 
 
 		 1028 aa  98.2  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  22.83 
 
 		 1060 aa  92.8  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  32.14 
 
 		 441 aa  50.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 442 aa  49.3  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 442 aa  49.3  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 442 aa  49.3  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 442 aa  48.5  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 442 aa  48.1  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 442 aa  48.1  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 442 aa  48.1  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 442 aa  48.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  30.36 
 
 		 442 aa  47  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  28.49 
 
 		 433 aa  47  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  28.49 
 
 		 433 aa  47  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  29.46 
 
 		 442 aa  44.7  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>