63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_R0100 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_R0100  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568264  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0006  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0000000531495  normal  0.328026 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0039  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000119185  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0029  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 91 bp  54  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt07  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815997  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0830  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  90 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0101  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000279606  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0023  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  0.0000000180291 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0598  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0023  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000058482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0015  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0181398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0035  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000342792  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1877  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000035739  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0050  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>