263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3143 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3143  adenosine deaminase  100 
 
 		 315 aa  658    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0188  adenosine deaminase  29.45 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  34.15 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  34.81 
 
 		 326 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  39.52 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  34.81 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  35.88 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2220  adenosine deaminase  34.76 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  35.21 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1064  Adenosine deaminase  32.94 
 
 		 350 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.718861  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  29.84 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  36.8 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  35.38 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  32.93 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0278  adenosine deaminase  27.12 
 
 		 327 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  36.22 
 
 		 354 aa  99.4  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  28.08 
 
 		 327 aa  99  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2662  adenosine deaminase  34.27 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  30.18 
 
 		 332 aa  98.2  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0534  adenosine deaminase  37.1 
 
 		 398 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479876  hitchhiker  0.00666941 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  36.59 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  35.04 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  32.84 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  28.9 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  28.9 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2337  adenosine deaminase  29.94 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  27.4 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0250  adenosine deaminase  33.08 
 
 		 327 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  35.25 
 
 		 340 aa  96.3  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  30.77 
 
 		 343 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  30.82 
 
 		 331 aa  96.3  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  29.41 
 
 		 345 aa  96.3  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1878  adenosine deaminase  28.81 
 
 		 334 aa  95.9  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1993  adenosine deaminase  28.81 
 
 		 334 aa  95.9  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  33.78 
 
 		 350 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3003  adenosine deaminase  31.33 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257915 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  30.67 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  34.09 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  31.5 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  28.9 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  28.9 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2142  adenosine deaminase  28.67 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.757317  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4458  adenosine deaminase  36.17 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  33.74 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2036  adenosine deaminase  29.38 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.96683  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  28.32 
 
 		 331 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  32.56 
 
 		 335 aa  92.4  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  28.32 
 
 		 331 aa  92.4  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  28.32 
 
 		 331 aa  92.4  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  31.94 
 
 		 328 aa  92.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  35.43 
 
 		 349 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  32.92 
 
 		 349 aa  91.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00582  adenosine deaminase  28.98 
 
 		 334 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  28.32 
 
 		 331 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  29.2 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  31.72 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  30.5 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  30.5 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  31.72 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  33.58 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001910  adenosine deaminase  29.03 
 
 		 334 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  28.47 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  30.5 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  30.5 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  30.5 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  30.5 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  34.65 
 
 		 360 aa  90.1  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  31.72 
 
 		 682 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  31.72 
 
 		 682 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  33.11 
 
 		 341 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  33.09 
 
 		 340 aa  89.7  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  33.09 
 
 		 361 aa  89.7  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  34.53 
 
 		 341 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  32.39 
 
 		 353 aa  89.4  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  28.04 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  28.48 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  29.14 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  30 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  30.49 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  27.59 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  31.69 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1904  adenosine deaminase  27.84 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2323  adenosine deaminase  29.22 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  35.71 
 
 		 342 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  27.41 
 
 		 336 aa  87  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  33.07 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  31.39 
 
 		 337 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  27.39 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  32.28 
 
 		 322 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  33.09 
 
 		 341 aa  86.7  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  27.27 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  29.8 
 
 		 375 aa  86.7  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0041  adenosine deaminase  34.65 
 
 		 332 aa  86.3  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  28.57 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  28.57 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0692  adenosine deaminase  27.64 
 
 		 335 aa  85.9  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  33.59 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  27.31 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  28.57 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  26.9 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>