More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2626 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2626  uridylate kinase  100 
 
 
234 aa  480  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000002022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  49.34 
 
 
235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  49.57 
 
 
237 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  49.57 
 
 
237 aa  230  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  48.05 
 
 
239 aa  229  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  49.14 
 
 
240 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  49.57 
 
 
240 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  47.62 
 
 
240 aa  222  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  45.45 
 
 
242 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0444  uridylate kinase  46.72 
 
 
235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.014483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  46.32 
 
 
240 aa  219  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  45.3 
 
 
241 aa  216  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0646  uridylate kinase  45.25 
 
 
238 aa  214  5.9999999999999996e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289065  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  44.92 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  44.64 
 
 
239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  43.97 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  46.32 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  41.81 
 
 
246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  43.78 
 
 
255 aa  210  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  45.06 
 
 
239 aa  209  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  45.26 
 
 
238 aa  209  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  44.1 
 
 
237 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  43.29 
 
 
235 aa  208  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  45.02 
 
 
251 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  40.26 
 
 
241 aa  207  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  45.02 
 
 
251 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  45.02 
 
 
251 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  40.26 
 
 
241 aa  207  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  43.83 
 
 
244 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  43.97 
 
 
241 aa  207  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  43.53 
 
 
253 aa  206  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0474  uridylate kinase  42.92 
 
 
245 aa  207  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  43.1 
 
 
240 aa  206  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  40.26 
 
 
235 aa  206  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  44.87 
 
 
239 aa  206  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  44.16 
 
 
238 aa  205  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  43.29 
 
 
241 aa  205  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  40.95 
 
 
240 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  43.53 
 
 
235 aa  205  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  42.92 
 
 
241 aa  204  6e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1513  uridylate kinase  42.49 
 
 
242 aa  204  8e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00553503  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1369  uridylate kinase  44.68 
 
 
245 aa  204  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  43.72 
 
 
240 aa  204  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  42.74 
 
 
239 aa  204  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  42.67 
 
 
253 aa  203  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1034  uridylate kinase  45.89 
 
 
240 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115262  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  43.29 
 
 
240 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  43.35 
 
 
237 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  43.35 
 
 
237 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  43.78 
 
 
241 aa  204  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  44.64 
 
 
240 aa  203  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  41.81 
 
 
242 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  44.16 
 
 
239 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  42.06 
 
 
241 aa  203  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  42.67 
 
 
235 aa  203  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  40.52 
 
 
240 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  44.21 
 
 
240 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  42.55 
 
 
238 aa  202  3e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  41.99 
 
 
247 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  41.99 
 
 
246 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  42.55 
 
 
244 aa  202  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  44.21 
 
 
240 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  42.49 
 
 
234 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1386  uridylate kinase  43.83 
 
 
245 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273157 
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  42.49 
 
 
241 aa  201  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3866  uridylate kinase  48.71 
 
 
240 aa  201  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0152776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3676  uridylate kinase  48.71 
 
 
240 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3566  uridylate kinase  48.71 
 
 
240 aa  201  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.077346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3584  uridylate kinase  48.71 
 
 
240 aa  201  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  44.83 
 
 
249 aa  201  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3872  uridylate kinase  48.71 
 
 
240 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000594608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3963  uridylate kinase  48.71 
 
 
240 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0920824  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3648  uridylate kinase  48.71 
 
 
240 aa  201  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3837  uridylate kinase  48.71 
 
 
240 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.33884e-62 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  43.72 
 
 
239 aa  201  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  43.78 
 
 
244 aa  201  9e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2477  uridylate kinase  48.28 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000191921  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  41.81 
 
 
266 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  41.56 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4959  uridylate kinase  42.92 
 
 
248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  41.56 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  43.1 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  42.06 
 
 
234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3923  uridylate kinase  48.28 
 
 
240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0560874  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  40.09 
 
 
240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  42.92 
 
 
252 aa  199  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1320  uridylate kinase  48.28 
 
 
240 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017232  hitchhiker  2.23199e-16 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  41.88 
 
 
235 aa  199  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  42.24 
 
 
242 aa  198  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  40.95 
 
 
238 aa  198  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  41.88 
 
 
236 aa  198  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  40.17 
 
 
239 aa  198  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  40.26 
 
 
274 aa  198  7e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  41.63 
 
 
234 aa  197  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12897  uridylate kinase  41.7 
 
 
261 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  41.99 
 
 
234 aa  197  7.999999999999999e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  42.31 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1163  uridylate kinase  41.2 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  43.78 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  45.45 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>