35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0997 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0997  membrane protein  100 
 
 		 160 aa  314  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1487  membrane protein  81.17 
 
 		 154 aa  254  4e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187632  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  54.78 
 
 		 157 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  50.42 
 
 		 122 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  43.07 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  40.74 
 
 		 155 aa  90.5  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1353  hypothetical protein  38.02 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  41.9 
 
 		 138 aa  90.1  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4921  hypothetical protein  40.85 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  42.61 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  37.12 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  37.12 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  40.98 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  39.1 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1232  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0711064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  36.3 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  34.91 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0996  hypothetical protein  31.88 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.686278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18211  hypothetical protein  40.91 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0901  hypothetical protein  35.34 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2971  hypothetical protein  42.16 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  38.1 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  30 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2922  hypothetical protein  34.09 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.389384 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1541  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.226032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1995  hypothetical protein  27.84 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  34.44 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  30.33 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  33.05 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1310  hypothetical protein  37.04 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1345  hypothetical protein  38.1 
 
 		 155 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.77021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1644  hypothetical protein  38.1 
 
 		 155 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0141  hypothetical protein  33.9 
 
 		 187 aa  42  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1160  hypothetical protein  38.27 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.541838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1411  hypothetical protein  35.29 
 
 		 145 aa  40.4  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>