125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1393 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1393  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  100 
 
 
674 aa  1412    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4428  glycoside hydrolase family protein  58.32 
 
 
668 aa  825    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.963425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2641  glycoside hydrolase family protein  64.18 
 
 
395 aa  513  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  27.13 
 
 
775 aa  239  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  27.62 
 
 
763 aa  233  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  26.12 
 
 
755 aa  219  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 
759 aa  211  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  31.86 
 
 
780 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  26.7 
 
 
720 aa  200  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  25.67 
 
 
761 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  27.12 
 
 
748 aa  197  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.77 
 
 
759 aa  197  7e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  25.45 
 
 
761 aa  195  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  26.29 
 
 
787 aa  193  9e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  25.68 
 
 
794 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  29.55 
 
 
965 aa  190  5.999999999999999e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  26.28 
 
 
755 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  25.24 
 
 
978 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  26.28 
 
 
755 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  26.42 
 
 
755 aa  188  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  26.27 
 
 
787 aa  187  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  26.13 
 
 
755 aa  185  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  26.13 
 
 
755 aa  185  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  26.13 
 
 
755 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  25.84 
 
 
755 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  25.6 
 
 
807 aa  183  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  24.73 
 
 
781 aa  181  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  25.99 
 
 
755 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.29 
 
 
777 aa  178  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  25.44 
 
 
762 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  28.19 
 
 
760 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  24.66 
 
 
789 aa  174  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  24.24 
 
 
749 aa  169  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  24.19 
 
 
769 aa  167  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  23.98 
 
 
757 aa  166  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  24.6 
 
 
776 aa  166  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.46 
 
 
1051 aa  165  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  23.55 
 
 
781 aa  160  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  24.42 
 
 
748 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  29.49 
 
 
780 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1155  Kojibiose phosphorylase  27.99 
 
 
704 aa  151  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.162173  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  28.57 
 
 
780 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  28.08 
 
 
753 aa  147  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09340  Acid trehalase Precursor (EC 3.2.1.28)(Alpha, alpha-trehalase)(Alpha,alpha-trehalose glucohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P78617]  24.59 
 
 
1002 aa  147  9e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.82562  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  24.11 
 
 
778 aa  146  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  27.27 
 
 
778 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0089  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  24.12 
 
 
777 aa  145  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472584  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  25.25 
 
 
710 aa  142  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  26.04 
 
 
825 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  26.91 
 
 
790 aa  140  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  26.68 
 
 
790 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  24.9 
 
 
774 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  24.2 
 
 
807 aa  139  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  28.09 
 
 
807 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  23.54 
 
 
1052 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  28.33 
 
 
1215 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3470  HAD family hydrolase  28.33 
 
 
1215 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0400404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3418  HAD family hydrolase  28.33 
 
 
1215 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.059768  normal  0.266902 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  23.82 
 
 
1053 aa  137  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80169  vacuolar acid trehalase  29.66 
 
 
1083 aa  135  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.135506  normal  0.979445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2887  family 65 glycoside hydrolase  27.93 
 
 
824 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  25.94 
 
 
848 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  34.82 
 
 
787 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  24.12 
 
 
1088 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.94 
 
 
1051 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  23.62 
 
 
794 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  28.5 
 
 
791 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  25.5 
 
 
795 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  24.97 
 
 
784 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  25.71 
 
 
789 aa  132  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  26.46 
 
 
795 aa  130  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  25.5 
 
 
795 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  26.67 
 
 
788 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  22.5 
 
 
858 aa  130  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  33.78 
 
 
804 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  28.64 
 
 
791 aa  129  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4811  trehalose 6-phosphate phosphorylase  25.61 
 
 
713 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  26.39 
 
 
789 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  26.67 
 
 
790 aa  127  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.67 
 
 
810 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2162  trehalose 6-phosphate phosphorylase  25.31 
 
 
807 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.40305 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13436  hypothetical protein  26.68 
 
 
786 aa  125  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0422368  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  22.49 
 
 
1053 aa  124  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  31 
 
 
750 aa  124  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000286879  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  23.46 
 
 
1055 aa  124  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1019  Kojibiose phosphorylase  29.51 
 
 
756 aa  124  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1283  glycoside hydrolase family protein 65  31.55 
 
 
806 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.461041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  26.65 
 
 
800 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  24.66 
 
 
784 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  27.29 
 
 
1225 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  24.05 
 
 
767 aa  121  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  22.68 
 
 
1050 aa  120  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4794  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.89 
 
 
807 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1109  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.08 
 
 
788 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.824966  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  24.12 
 
 
778 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1847  maltose phosphorylase  25 
 
 
751 aa  119  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.91 
 
 
786 aa  118  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  32.61 
 
 
786 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  30.99 
 
 
780 aa  117  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  23.13 
 
 
771 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.264043 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>