57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0729 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0729  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  566  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1931  hypothetical protein  44.17 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00090  hypothetical protein  39.39 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0835  hypothetical protein  29.6 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1287  DNA uptake protein and related DNA-binding protein  26.46 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1689  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  24.68 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.71012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4872  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  23.59 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  30.83 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  30.08 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1741  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  27.94 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0664  hypothetical protein  29.46 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1691  hypothetical protein  29.2 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.631866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2082  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  25.49 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.918222  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1704  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  24.38 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0496  DNA uptake-like protein  34.94 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0194671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1142  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat-containing protein  35 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.702524  normal  0.935531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2273  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  38.33 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1157  comE operon protein 1, putative  36.67 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3267  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  38.33 
 
 		 271 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00676892  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0329  DNA uptake protein  40.38 
 
 		 234 aa  49.7  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2087  comE operon protein 1, putative  31.15 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2375  putative comE operon protein 1  31.15 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0826  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  41.3 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0217462  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17420  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  37.04 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.711078  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03051  late competence protein (DNA binding and uptake)  29.58 
 
 		 105 aa  47  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.724355  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3198  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  35.82 
 
 		 102 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5471  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  24.41 
 
 		 225 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1233  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  30.7 
 
 		 171 aa  46.6  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1682  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  28.77 
 
 		 225 aa  45.8  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00173147  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1647  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  28.77 
 
 		 225 aa  45.8  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3087  putative competence protein ComEA  31.73 
 
 		 148 aa  45.8  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.07347e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3048  hypothetical protein  31.73 
 
 		 148 aa  45.8  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.872404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3229  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  31.73 
 
 		 148 aa  45.8  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.59864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12590  DNA uptake protein  33.87 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2489  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  35 
 
 		 99 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.632838  normal  0.0131987 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1257  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  36.51 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791854  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13270  DNA uptake protein  35 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2830  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  43.48 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.192028  normal  0.919156 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  37.1 
 
 		 587 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2967  Helix-hairpin-helix DNA-binding class 1  32.39 
 
 		 150 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2137  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  30.26 
 
 		 100 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3259  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  31.19 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.569705  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0462  ComE operon protein 1  39.68 
 
 		 83 aa  43.5  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0037  competence protein ComEA  35.38 
 
 		 79 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0368973  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0126  ComE operon protein (competence protein)  40.98 
 
 		 111 aa  43.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0011  competence protein ComEA  35.38 
 
 		 79 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00025095  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1175  DNA uptake protein related DNA-binding protein  29.82 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000209814  hitchhiker  0.00000760392 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0010  competence protein ComEA  33.85 
 
 		 79 aa  42.7  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0805  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  33.33 
 
 		 250 aa  42.4  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1953  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  42.11 
 
 		 238 aa  42.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00139923  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2033  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  38.89 
 
 		 93 aa  42.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000281796  hitchhiker  0.000016405 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1066  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  32.35 
 
 		 99 aa  42.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2544  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  26.21 
 
 		 121 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.644466  normal  0.0231779 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0922  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  32.35 
 
 		 99 aa  42.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1611  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  33.33 
 
 		 278 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0962  DNA uptake protein or related DNA-binding protein  36.67 
 
 		 109 aa  42  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3635  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  36.07 
 
 		 120 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.37256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>