51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1931 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1931  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  590  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00090  hypothetical protein  45.62 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0729  hypothetical protein  44.17 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0835  hypothetical protein  28.9 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1689  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  27.62 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.71012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4872  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  36.15 
 
 		 313 aa  85.5  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1287  DNA uptake protein and related DNA-binding protein  27.27 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  35.83 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  35 
 
 		 181 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0664  hypothetical protein  39.29 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1741  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33.33 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2082  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  26.56 
 
 		 169 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.918222  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1484  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  40.62 
 
 		 194 aa  49.3  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13270  DNA uptake protein  43.64 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0496  DNA uptake-like protein  34.72 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0194671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1562  Helix-hairpin-helix DNA-binding class 1  37.93 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0826  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  42.55 
 
 		 355 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0217462  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1611  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  42.59 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1230  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  42.31 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.890666  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2489  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  43.14 
 
 		 99 aa  47  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.632838  normal  0.0131987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4394  hypothetical protein  31.97 
 
 		 193 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1635  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  46.67 
 
 		 228 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1233  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  28.03 
 
 		 171 aa  46.6  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1691  hypothetical protein  29.25 
 
 		 234 aa  46.2  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.631866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2803  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  41.07 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1682  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  40.62 
 
 		 225 aa  45.8  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00173147  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1647  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  40.62 
 
 		 225 aa  45.8  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1008  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  26.47 
 
 		 114 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000463906  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3435  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  34.29 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218719  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1122  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  33.87 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.266281  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0570  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  40.38 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000494468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1508  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  42.55 
 
 		 127 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1737  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  34.62 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1704  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  25.68 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2662  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  31.33 
 
 		 105 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.648617  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1657  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  29.58 
 
 		 226 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.11522  hitchhiker  0.000932836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2273  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  38 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1103  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  42.31 
 
 		 187 aa  43.5  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000407291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1142  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat-containing protein  38.78 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.702524  normal  0.935531 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2156  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  39.29 
 
 		 90 aa  43.5  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.367346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2375  putative comE operon protein 1  36.67 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2512  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  30.08 
 
 		 213 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0407  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  35.56 
 
 		 131 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000244274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0217  RNA binding S1  24.79 
 
 		 864 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2087  comE operon protein 1, putative  36.67 
 
 		 254 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1944  DNA uptake protein related DNA-binding protein  43.75 
 
 		 200 aa  42.7  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.727384  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2071  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33.82 
 
 		 190 aa  42.7  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2650  RNA binding S1 domain protein  26.61 
 
 		 795 aa  42.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00533816  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3888  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  38 
 
 		 105 aa  42.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0912284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0329  DNA uptake protein  38.78 
 
 		 234 aa  42.7  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1157  comE operon protein 1, putative  44.44 
 
 		 224 aa  42.4  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>