19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0655 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0655  putative phage repressor  100 
 
 		 277 aa  569  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.119193  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5487  hypothetical protein  34.6 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 259 aa  132  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  37.1 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1827  hypothetical protein  34.29 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226709  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1968  XRE family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749676  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4920  putative phage repressor  40.67 
 
 		 255 aa  98.6  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2342  transcriptional regulator, XRE family  29.89 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000474992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1213  transcriptional regulator, XRE family  30.66 
 
 		 394 aa  89.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00829806  decreased coverage  0.0000499416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2028  transcriptional regulator, XRE family  31.79 
 
 		 273 aa  88.6  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13403  hypothetical protein  36.31 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1743  transcriptional regulator, XRE family  25.9 
 
 		 402 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2075  putative phage repressor  31.74 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00940  transcriptional regulator  27.95 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5589  putative phage repressor  20.92 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  35.34 
 
 		 217 aa  45.8  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_002950  PG1063  transcriptional regulator, putative  30.56 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.150252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3873  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.647087  normal  0.150356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>