17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0615 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0615  putative RNA methylase  100 
 
 
247 aa  494  1e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1984  putative RNA methylase  28.79 
 
 
227 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  29.7 
 
 
225 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  30.46 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  29.02 
 
 
224 aa  57  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  30.21 
 
 
304 aa  54.7  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  26.54 
 
 
346 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  22.03 
 
 
374 aa  50.1  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  28.22 
 
 
322 aa  49.3  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  29.08 
 
 
336 aa  47.8  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  25.39 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  27.5 
 
 
317 aa  46.6  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  29.01 
 
 
317 aa  46.2  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  27.78 
 
 
359 aa  45.4  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  28.9 
 
 
355 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  36.92 
 
 
792 aa  42  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  33.85 
 
 
920 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>