38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0613 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0613  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  352  1e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2219  conserved hypothetical protein  47.85 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0123  hypothetical protein  47.4 
 
 
176 aa  157  5e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0141  hypothetical protein  45.12 
 
 
176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0775358 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0153  hypothetical protein  42.86 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1191  hypothetical protein  45.4 
 
 
176 aa  137  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0853  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  43.29 
 
 
172 aa  134  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.313328  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1369  hypothetical protein  45.91 
 
 
181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  38.04 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  32.72 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  36 
 
 
171 aa  82  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  30.92 
 
 
181 aa  77.4  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  33.93 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  28.31 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  52  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  32.87 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  28.67 
 
 
157 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  24.49 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_587  hypothetical protein  27.22 
 
 
196 aa  45.4  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756332  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  45.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4511  hypothetical protein  30.37 
 
 
185 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  29.01 
 
 
148 aa  44.7  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  32.54 
 
 
176 aa  44.3  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0619  hypothetical protein  27.22 
 
 
209 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505502  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  27.43 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  27.43 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  35 
 
 
152 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  27.43 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0682  hypothetical protein  34.15 
 
 
138 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.304862  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0648  hypothetical protein  34.15 
 
 
138 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0149503  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  27.68 
 
 
186 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2568  hypothetical protein  24.32 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  29.09 
 
 
159 aa  42  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2931  hypothetical protein  31.88 
 
 
178 aa  42  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2422  hypothetical protein  25.55 
 
 
190 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  23.48 
 
 
154 aa  42  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  28.45 
 
 
196 aa  41.2  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  32.23 
 
 
195 aa  40.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>