More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1951 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1951  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 399 aa  826    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.492369  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  76.92 
 
 		 379 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  74.2 
 
 		 378 aa  587  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  71.28 
 
 		 377 aa  568  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  69.23 
 
 		 377 aa  555  1e-157  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  59.04 
 
 		 381 aa  474  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  32.11 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0948  oxidoreductase domain protein  33.25 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.191297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  30.59 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 		 370 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  26.23 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 		 369 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  33.45 
 
 		 396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 		 376 aa  133  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  27.64 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  30.1 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  24.35 
 
 		 373 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  30.18 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  30.58 
 
 		 366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  31.97 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  31.19 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  37.37 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  30.9 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  23.85 
 
 		 371 aa  113  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 		 377 aa  113  6e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  26.53 
 
 		 371 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  31.91 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  31.13 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  31.91 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.91 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  26.53 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 		 375 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 		 387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.56 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  27.7 
 
 		 369 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  26.74 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  25.55 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  24.43 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  27.53 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 388 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 371 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  24.75 
 
 		 371 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  33.18 
 
 		 366 aa  106  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3402  oxidoreductase, putative  29.63 
 
 		 338 aa  106  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336464  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  29.11 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  30.11 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3305  oxidoreductase domain-containing protein  29.25 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  29.54 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3639  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671652  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0790  putative oxidoreductase  25 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 		 393 aa  103  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 		 355 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  26.2 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  31 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08431  putative oxidoreductase  24.48 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  26.71 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  27.79 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  29.68 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  31.76 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  30.38 
 
 		 419 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07991  putative oxidoreductase  31.36 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.716989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  30.33 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32.49 
 
 		 356 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  29.09 
 
 		 360 aa  99.8  7e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 		 388 aa  99.8  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 		 385 aa  99.4  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  24.46 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4400  oxidoreductase-like protein  32 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4487  oxidoreductase domain-containing protein  32 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08461  putative oxidoreductase  23.97 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336432  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  24.46 
 
 		 366 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25.17 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1754  oxidoreductase domain-containing protein  29.74 
 
 		 347 aa  98.6  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0879684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4781  oxidoreductase domain-containing protein  31.2 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  26.51 
 
 		 373 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  29.53 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  32.02 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  23.54 
 
 		 369 aa  96.7  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  28.07 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 398 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 347 aa  94.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.67 
 
 		 353 aa  94  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 		 353 aa  94  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  28.39 
 
 		 378 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  25.65 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0294  oxidoreductase domain-containing protein  29.73 
 
 		 384 aa  93.6  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.950002  normal  0.780487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>