55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1723 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1723  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  100 
 
 		 172 aa  355  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1910  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  67.46 
 
 		 176 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1519  hypothetical protein  59.64 
 
 		 174 aa  217  7e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1613  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  57.23 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1737  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  51.85 
 
 		 169 aa  168  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2695  hypothetical protein  39.16 
 
 		 187 aa  137  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  39.78 
 
 		 500 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  38.8 
 
 		 493 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  40.24 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1659  hypothetical protein  35.37 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0395297  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1050  hypothetical protein  39.86 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.2468  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  37.43 
 
 		 500 aa  117  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  39.89 
 
 		 491 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  39.89 
 
 		 491 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2349  hypothetical protein  39.6 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  40 
 
 		 494 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2484  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.93 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0513  hypothetical protein  33.94 
 
 		 166 aa  87.8  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2491  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.54 
 
 		 178 aa  87.4  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3121  hypothetical protein  32.92 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2199  hypothetical protein  34.62 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1439  hypothetical protein  32.3 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2110  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.12 
 
 		 169 aa  85.1  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.484731  normal  0.386496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2934  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.3 
 
 		 178 aa  84.3  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.377598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2814  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.68 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1563  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.3 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177112  hitchhiker  0.000729597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2794  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.06 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1427  hypothetical protein  31.06 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0272472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1374  hypothetical protein  30.43 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2258  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.77 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1666  hypothetical protein  31.48 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.399855  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3246  hypothetical protein  33.12 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0933  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.64 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36846  predicted protein  32.89 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3798  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.84 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  0.343807 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33613  predicted protein  30.13 
 
 		 199 aa  62  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895112  normal  0.0480092 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0474  hypothetical protein  32.64 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52100  possible complex I intermediate associated protein  29.63 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0780  hypothetical protein  29.37 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388064  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49580  predicted protein  29.63 
 
 		 247 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1258  hypothetical protein  27.78 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05938  conserved hypothetical protein  27.68 
 
 		 272 aa  51.6  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1559  predicted protein  31.58 
 
 		 486 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09901  hypothetical protein  26.32 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.133858  normal  0.286741 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16901  hypothetical protein  28.38 
 
 		 189 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.381808 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0491  hypothetical protein  34.67 
 
 		 186 aa  48.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.802373  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1224  hypothetical protein  25.69 
 
 		 186 aa  47.8  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151569  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12141  hypothetical protein  34.67 
 
 		 186 aa  47.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119688  Probable complex I intermediate-associated protein 30-like protein  28.7 
 
 		 402 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17110  predicted protein  31.43 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0710818  normal  0.446796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4021  hypothetical protein  30.43 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.986867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08101  hypothetical protein  27.78 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0178  hypothetical protein  27.78 
 
 		 193 aa  45.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1246  hypothetical protein  30.97 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000296888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3775  hypothetical protein  28.32 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0750974  normal  0.0561061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>