More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0571 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0540  ABC transporter ATP-binding protein uup  63.24 
 
 		 644 aa  791    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.692263  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0967  ABC transporter, ATP-binding protein  75.31 
 
 		 643 aa  948    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1433  ABC transporter related protein  54.79 
 
 		 649 aa  656    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0571  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 645 aa  1287    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.940937  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0077  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  63.98 
 
 		 644 aa  808    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0439155  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0925  ABC transporter, ATP-binding protein  74.84 
 
 		 643 aa  959    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.511016  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0619  ABC transporter ATP-binding protein uup  61.78 
 
 		 646 aa  781    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.828103  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0644  peptidase T (tripeptide aminopeptidase; aminotripeptidase; tripeptidase)  64.19 
 
 		 643 aa  822    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0897  ABC transporter, ATP-binding protein  75.93 
 
 		 643 aa  969    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1268  ABC transporter-related protein  50.69 
 
 		 646 aa  625  1e-178  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  38.05 
 
 		 632 aa  395  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  36.89 
 
 		 642 aa  388  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  36.06 
 
 		 641 aa  388  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  35.74 
 
 		 663 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  34.92 
 
 		 642 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  35.74 
 
 		 636 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  33.99 
 
 		 649 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  34.11 
 
 		 637 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  34.29 
 
 		 649 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  36.49 
 
 		 632 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  34.11 
 
 		 637 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  34.11 
 
 		 637 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  34.29 
 
 		 649 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  34.59 
 
 		 636 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  33.54 
 
 		 640 aa  368  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  34.09 
 
 		 661 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  34.09 
 
 		 661 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  35.71 
 
 		 646 aa  364  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  33.96 
 
 		 626 aa  364  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  34.29 
 
 		 688 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  36.93 
 
 		 639 aa  363  6e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4373  ABC transporter-related protein  35.08 
 
 		 629 aa  363  7.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0223118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 		 646 aa  362  1e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  36.35 
 
 		 647 aa  362  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  34.45 
 
 		 648 aa  361  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  34.2 
 
 		 641 aa  361  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  36.16 
 
 		 634 aa  361  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  34.66 
 
 		 640 aa  360  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  34.55 
 
 		 638 aa  360  4e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  34.16 
 
 		 635 aa  360  6e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  34.19 
 
 		 645 aa  359  8e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  33.49 
 
 		 633 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  36.04 
 
 		 639 aa  359  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  35.32 
 
 		 636 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  33.23 
 
 		 649 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  34.83 
 
 		 628 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  34.49 
 
 		 632 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  34.36 
 
 		 635 aa  357  5e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  33.64 
 
 		 644 aa  357  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2659  ABC transporter ATPase component  35.17 
 
 		 638 aa  357  5e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  34.67 
 
 		 628 aa  357  5.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  33.69 
 
 		 660 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  33.38 
 
 		 631 aa  356  8.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  33.69 
 
 		 648 aa  356  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  33.69 
 
 		 648 aa  356  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  33.69 
 
 		 648 aa  356  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  33.69 
 
 		 660 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  33.69 
 
 		 660 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  33.85 
 
 		 635 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  34.16 
 
 		 635 aa  353  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  34.16 
 
 		 635 aa  353  7e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  34.16 
 
 		 635 aa  353  7e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  34.16 
 
 		 635 aa  353  7e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  34.16 
 
 		 635 aa  353  7e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  34.16 
 
 		 635 aa  353  7e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  33.69 
 
 		 1065 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  33.53 
 
 		 648 aa  353  8e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1650  ABC transporter related protein  33.75 
 
 		 641 aa  352  8.999999999999999e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  33.86 
 
 		 648 aa  352  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  34 
 
 		 635 aa  352  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  33.69 
 
 		 635 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  33.69 
 
 		 635 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  33.69 
 
 		 635 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  34.55 
 
 		 640 aa  350  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  33.85 
 
 		 635 aa  349  7e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1553  ABC transporter ATPase component  35.58 
 
 		 636 aa  349  9e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  33.69 
 
 		 635 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2468  ABC transporter ATPase component  34.2 
 
 		 640 aa  348  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000565711  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  33.7 
 
 		 650 aa  349  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  34.6 
 
 		 640 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  34.6 
 
 		 640 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  33.01 
 
 		 643 aa  348  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  33.99 
 
 		 634 aa  347  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  34.25 
 
 		 639 aa  347  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  34.76 
 
 		 640 aa  345  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1987  hypothetical protein  34.67 
 
 		 617 aa  345  1e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1982  hypothetical protein  34.67 
 
 		 617 aa  345  1e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2512  ABC transporter related  32.6 
 
 		 620 aa  345  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2893  ABC transporter, ATP-binding protein  32.6 
 
 		 620 aa  345  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.669618  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  31.18 
 
 		 635 aa  345  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  33.99 
 
 		 641 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  33.81 
 
 		 641 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  33.63 
 
 		 649 aa  343  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0642  ABC transporter related  33.38 
 
 		 629 aa  344  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.64323  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  33.84 
 
 		 641 aa  343  7e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  33.84 
 
 		 641 aa  343  7e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  33.84 
 
 		 641 aa  343  7e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  33.84 
 
 		 641 aa  343  7e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  34.14 
 
 		 653 aa  342  9e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  34.48 
 
 		 641 aa  342  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>