31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2495 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2495  hypothetical protein  100 
 
 
543 aa  1031    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2962  hypothetical protein  49.32 
 
 
547 aa  348  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.41173  hitchhiker  0.00173595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27870  hypothetical protein  45.79 
 
 
515 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3158  hypothetical protein  49.12 
 
 
542 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8552  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.63 
 
 
587 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8187  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.72 
 
 
593 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.38 
 
 
440 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.73 
 
 
580 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0373  hypothetical protein  26.27 
 
 
454 aa  67.8  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.417823  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.29 
 
 
471 aa  67  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.298298  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0027  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.74 
 
 
367 aa  63.9  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0814  hypothetical protein  32.02 
 
 
420 aa  59.7  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0429314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25300  membrane-fusion protein  32.82 
 
 
379 aa  54.7  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36 
 
 
605 aa  53.9  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4328  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.65 
 
 
568 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238879  normal  0.546066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0084  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.5 
 
 
408 aa  51.6  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0082  hypothetical protein  37.08 
 
 
391 aa  51.2  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.619134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4786  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.48 
 
 
376 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0569189  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0306  hypothetical protein  46.3 
 
 
401 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1030  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.81 
 
 
410 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0582  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.67 
 
 
405 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246879  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1625  hypothetical protein  31.1 
 
 
179 aa  47  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  33.33 
 
 
335 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1588  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.58 
 
 
359 aa  44.7  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0248929  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  30.72 
 
 
371 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  30.72 
 
 
371 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  30.72 
 
 
371 aa  43.5  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  30.72 
 
 
371 aa  43.5  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  30.72 
 
 
371 aa  43.5  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  30.72 
 
 
371 aa  43.5  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  30.72 
 
 
371 aa  43.5  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>