34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1248 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1248  Protein of unknown function DUF2207, membrane  100 
 
 
652 aa  1270    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  47.96 
 
 
634 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0661  hypothetical protein  35.28 
 
 
573 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0929  hypothetical protein  33.87 
 
 
547 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0961263  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0484  hypothetical protein  33.91 
 
 
498 aa  225  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0480409  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2921  hypothetical protein  34.16 
 
 
581 aa  211  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4324  hypothetical protein  32.16 
 
 
613 aa  153  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0859  hypothetical protein  32.22 
 
 
549 aa  121  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00278552  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1259  membrane protein-like protein  25.3 
 
 
649 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  25.76 
 
 
626 aa  88.2  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0514  membrane-like protein  24.3 
 
 
639 aa  88.2  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3926  hypothetical protein  34.01 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2685  hypothetical protein  25.1 
 
 
607 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.561749  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0534  hypothetical protein  23.84 
 
 
644 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2428  hypothetical protein  22.93 
 
 
606 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554313  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2381  hypothetical protein  22.93 
 
 
606 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3732  hypothetical protein  24.73 
 
 
609 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0265858  normal  0.0706106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2422  hypothetical protein  22.93 
 
 
606 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651701  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0577  hypothetical protein  22.84 
 
 
644 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.464541  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1466  hypothetical protein  29.83 
 
 
465 aa  64.3  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1493  hypothetical protein  26.04 
 
 
679 aa  58.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0707557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0399  hypothetical protein  26.18 
 
 
438 aa  58.2  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719971  normal  0.0793773 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0576  putative transmembrane signal peptide protein  24.18 
 
 
652 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000285101  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1067  hypothetical protein  30 
 
 
756 aa  56.6  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0145  hypothetical protein  20.22 
 
 
633 aa  55.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1381  hypothetical protein  26.99 
 
 
661 aa  55.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0465  putative transmembrane signal peptide protein  26.29 
 
 
644 aa  53.5  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.559326  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0361  hypothetical protein  25.7 
 
 
607 aa  53.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4521  membrane-like protein  29.69 
 
 
656 aa  52.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180216  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2702  hypothetical protein  22.34 
 
 
686 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.728623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3740  hypothetical protein  22.08 
 
 
685 aa  52  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1065  hypothetical protein  31.01 
 
 
604 aa  50.8  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0464  hypothetical protein  24.75 
 
 
566 aa  50.4  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0818  hypothetical protein  22.03 
 
 
543 aa  44.7  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0165146  hitchhiker  0.0000000000172103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>