28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_14220 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_14220  histidine kinase  100 
 
 		 283 aa  586  1e-166  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0001  transcriptional regulator, TrmB  65.85 
 
 		 371 aa  233  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000656108  hitchhiker  0.000000126577 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28560  histidine kinase  45.15 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000031694  hitchhiker  0.000525882 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0001  ATP-binding region ATPase domain protein  35.36 
 
 		 288 aa  166  5.9999999999999996e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.557706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3217  transcriptional regulator, TrmB  30.56 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.770458  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 490 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4427  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 418 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 468 aa  46.6  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0091  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 413 aa  46.6  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70693  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0899  Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 382 aa  45.8  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.218475  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0282  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 411 aa  45.8  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000209269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3739  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 411 aa  45.8  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0303484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0283  ATPase domain-containing protein  27.55 
 
 		 411 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143698  hitchhiker  0.000000382002 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1213  sensor histidine kinase KdpD  25 
 
 		 900 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2201  multisensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 633 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0026  sensory histidine kinase CreC  31.91 
 
 		 480 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 530 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 978 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1464  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 663 aa  43.5  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0915  histidine kinase  30.11 
 
 		 176 aa  43.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.932987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 837 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  28.97 
 
 		 408 aa  42.7  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  27.27 
 
 		 736 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 426 aa  42.7  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 657 aa  42.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 		 307 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 444 aa  42.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0334  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 		 149 aa  42.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>