59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00510 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_00510  DMSO reductase anchor subunit  100 
 
 
287 aa  558  1e-158  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2253  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.14 
 
 
286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.285231  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0466  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.33 
 
 
292 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598876  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0456  hypothetical protein  29.84 
 
 
315 aa  105  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24580  DMSO reductase anchor subunit  32.57 
 
 
298 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0426  putative dimethyl sulfoxide reductase anchor subunit  29.79 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.905194  hitchhiker  0.00000175345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3392  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  30.53 
 
 
286 aa  95.9  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0920  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  30.53 
 
 
286 aa  95.9  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2790  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  28.72 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0145436 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3259  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  30.09 
 
 
286 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00907  hypothetical protein  29.51 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.115308  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00900  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C  29.51 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123294  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1031  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  29.86 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1420  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  30 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1689  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  27.21 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0746368 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1000  dmso reductase anchor subunit  29.86 
 
 
287 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1065  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.86 
 
 
287 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000142523  normal  0.658942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1080  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.86 
 
 
287 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0971  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.51 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06860  DMSO reductase anchor subunit  32.57 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.139777 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0972  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.86 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1058  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.86 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2747  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  29.86 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72302  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2700  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  29.86 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2432  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.86 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2224  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.41 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.83571 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1001  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  29.86 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  31.76 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2299  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  31.76 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149119 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1797  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  31.76 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1776  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  31.76 
 
 
284 aa  79  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01549  hypothetical protein  32.43 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01559  oxidoreductase, membrane subunit  32.43 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2053  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.43 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.572906  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1663  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  32.43 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2040  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.43 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1598  dmso reductase anchor subunit  28.72 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448472  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00530  DMSO reductase anchor subunit  24.64 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1843  dmso reductase anchor subunit  28.21 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.882429  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1607  dmso reductase anchor subunit  28.21 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1676  dmso reductase anchor subunit  27.69 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.088493  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1666  dmso reductase anchor subunit  27.69 
 
 
285 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16870  hypothetical protein  25.29 
 
 
289 aa  52.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02505  hypothetical protein  29.7 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0114  Polysulphide reductase NrfD  26.88 
 
 
292 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0549  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  29.8 
 
 
284 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1454  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  28.74 
 
 
258 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2718  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.74 
 
 
258 aa  49.7  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1342  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  28.74 
 
 
258 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4653  dmso reductase anchor subunit  28.48 
 
 
257 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22760  DMSO reductase anchor subunit  28.71 
 
 
289 aa  49.3  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4562  dmso reductase anchor subunit  27.22 
 
 
257 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4653  dmso reductase anchor subunit  27.95 
 
 
257 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4702  dmso reductase anchor subunit  27.22 
 
 
257 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4570  dmso reductase anchor subunit  27.22 
 
 
257 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3029  hypothetical protein  30.19 
 
 
299 aa  45.8  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2766  DMSO reductase anchor subunit-like protein  27.85 
 
 
269 aa  45.8  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.740952 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3745  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  29.82 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0572  DMSO reductase chain C  34.31 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000032468  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>