20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16870 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16870  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  571  1.0000000000000001e-162  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22760  DMSO reductase anchor subunit  54.98 
 
 
289 aa  293  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0499  hypothetical protein  45.39 
 
 
301 aa  222  6e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.405483 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0509  hypothetical protein  46.05 
 
 
301 aa  206  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.649169 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0517  hypothetical protein  43.38 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.403462 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0513  hypothetical protein  43.38 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.63871 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0503  hypothetical protein  44.74 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0469  hypothetical protein  36.86 
 
 
289 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3029  hypothetical protein  35.1 
 
 
299 aa  152  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27330  hypothetical protein  32.88 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06140  DMSO reductase anchor subunit  34.23 
 
 
303 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0114  Polysulphide reductase NrfD  33.72 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0609  hypothetical protein  29.76 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.907948  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2766  DMSO reductase anchor subunit-like protein  28.73 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.740952 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00510  DMSO reductase anchor subunit  25.29 
 
 
287 aa  52.4  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2343  DMSO reductase anchor subunit-like protein  26.46 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.32375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0129  cyclic nucleotide-binding protein  27.04 
 
 
272 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0549  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  24.75 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2924  putative anaerobic DMSO reductase chain C anchor subunit  26.49 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00138794  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2565  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  23.64 
 
 
275 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000475988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>