33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0456 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0456  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  600  1e-170  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00510  DMSO reductase anchor subunit  29.84 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0466  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  28.34 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00530  DMSO reductase anchor subunit  23.08 
 
 		 350 aa  65.9  0.0000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2790  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  30.59 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0145436 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2253  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  25.4 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.285231  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24580  DMSO reductase anchor subunit  24.78 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2766  DMSO reductase anchor subunit-like protein  28.88 
 
 		 269 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.740952 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0920  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  26.85 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3392  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  26.85 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3259  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  26.17 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1676  dmso reductase anchor subunit  25.17 
 
 		 285 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.088493  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1598  dmso reductase anchor subunit  25.83 
 
 		 285 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448472  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1607  dmso reductase anchor subunit  24.5 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1843  dmso reductase anchor subunit  25.17 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.882429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1666  dmso reductase anchor subunit  25.17 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0114  Polysulphide reductase NrfD  30.29 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00907  hypothetical protein  25.53 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.115308  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00900  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C  25.53 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01559  oxidoreductase, membrane subunit  25.17 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2053  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  25.17 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.572906  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1663  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  25.17 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2040  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  25.17 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01549  hypothetical protein  25.17 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06860  DMSO reductase anchor subunit  26.67 
 
 		 288 aa  43.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.139777 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1689  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  24.62 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0746368 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1797  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  24.5 
 
 		 284 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2700  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  25.53 
 
 		 287 aa  42.7  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  24.5 
 
 		 284 aa  42.7  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1001  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  25.53 
 
 		 287 aa  42.7  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2747  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  25.53 
 
 		 287 aa  42.7  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72302  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1776  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  24.5 
 
 		 284 aa  42.7  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2432  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  25.53 
 
 		 287 aa  42.7  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>