83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0523 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0523  germination protein, Ger(x)C family  100 
 
 
399 aa  818    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0669  spore germination B3 GerAC like  28.43 
 
 
436 aa  204  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2955  germination protein, Ger(x)C family  24.68 
 
 
429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1935  spore germination B3 GerAC family protein  23.14 
 
 
381 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00120  spore germination B3 GerAC family protein  26.4 
 
 
391 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0298  germination protein, Ger(x)C family  22.14 
 
 
407 aa  124  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0584  germination protein, Ger(x)C family  24.68 
 
 
407 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1265  germination protein, Ger(x)C family  22.19 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1969  germination protein, Ger(x)C family  23.86 
 
 
437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2165  germination protein, Ger(x)C family  26.18 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.370833  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1734  spore germination B3 GerAC family protein  22.11 
 
 
423 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0845  germination protein, Ger(x)C family  21.74 
 
 
389 aa  99.4  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0053  spore germination B3 GerAC family protein  22.9 
 
 
402 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2465  germination protein, Ger(x)C family  21.59 
 
 
401 aa  92.8  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3013  germination protein, Ger(x)C family  23.69 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0804  spore germination B3 GerAC family protein  22.22 
 
 
394 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.896679  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2767  germination protein, Ger(x)C family  24.74 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000418614  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3201  spore germination B3 GerAC family protein, putative  21.63 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2064  spore germination B3 GerAC like  22.86 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0147375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0875  germination protein, Ger(x)C family  22.33 
 
 
392 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3281  germination protein, Ger(x)C family  21.5 
 
 
392 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000713918  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1462  spore germination B3 GerAC like  21.22 
 
 
416 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0602  germination protein, Ger(x)C family  21.78 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0268428  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2040  spore germination B3 GerAC like  19.17 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0138  spore germination protein KC  21.7 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0605  spore germination B3 GerAC family protein  23.83 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3658  spore germination B3 GerAC family protein  23.75 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0249  germination protein, Ger  24.24 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.508454  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1193  hypothetical protein  22.66 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0059  germination protein, Ger(x)C family  26.23 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.727397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4846  spore germination protein GerHC  20.7 
 
 
359 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.504224  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0077  hypothetical protein  19.95 
 
 
381 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0075  hypothetical protein  21.51 
 
 
379 aa  61.6  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3119  spore germination protein, GerC family  21.25 
 
 
359 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4592  spore germination protein GerLC  22.89 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1768  germination protein, Ger(x)C family  20.69 
 
 
361 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2118  spore germination protein, GerC family  21.25 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0745  spore germination protein GerLC  23.13 
 
 
380 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3140  spore germination protein, GerC family  21.25 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2886  GerC family spore germination protein  21.25 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0825942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0621  spore germination protein  20.57 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2457  germination protein, Ger(x)C family  20.91 
 
 
382 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0726  spore germination protein GerYC  20.07 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0762  spore germination protein GerYC  20.07 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0780  spore germination protein GerLC  20.58 
 
 
388 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0599  spore germination B3 GerAC family protein  21.22 
 
 
374 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2666  spore germination B3 GerAC family protein  19.21 
 
 
373 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0626  spore germination B3 GerAC family protein  20.64 
 
 
388 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0676  spore germination protein (GerAC)  19.73 
 
 
360 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4485  spore germination protein  21.48 
 
 
361 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0157  spore germination protein GerLC  22.49 
 
 
387 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0676  spore germination B3 GerAC family protein  20.07 
 
 
360 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0677  spore germination protein GerLC  20.8 
 
 
391 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0621  spore germination protein  20.8 
 
 
391 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0833  spore germination protein GerYC  20.14 
 
 
270 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9712e-56 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0765  spore germination protein GerLC  20.79 
 
 
380 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102303 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4466  spore germination protein  21.48 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4854  spore germination protein GerHC  21 
 
 
359 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4632  spore germination protein GerHC  21 
 
 
359 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.589886  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0711  spore germination protein GerLC  20.71 
 
 
388 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4986  spore germination protein GerHC  21 
 
 
359 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1013  spore germination B3 GerAC like  20.49 
 
 
325 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000988882 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0664  spore germination protein AC  20.07 
 
 
360 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2437  germination protein, Ger(x)C family  19.42 
 
 
399 aa  50.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4871  spore germination protein GerHC  21.14 
 
 
361 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4876  spore germination protein GerHC  21.48 
 
 
361 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5575  spore germination B3 GerAC family protein  23.26 
 
 
352 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.472253 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0390  spore germination protein GerHC  19.31 
 
 
359 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3410  spore germination B3 GerAC family protein  19.31 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2752  spore germination protein XC  31.25 
 
 
386 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0633  spore germination protein GerKC  21.41 
 
 
374 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0600  spore germination protein GerKC  21.41 
 
 
374 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3136  spore germination protein GerAC  22.28 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0544  spore germination protein  20.91 
 
 
374 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.157397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3165  spore germination protein GerAC  28.81 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2902  spore germination protein  28.81 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000153025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0669  spore germination protein GerKC  21.61 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3158  spore germination protein GerAC  28.81 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148568 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0701  spore germination protein GerKC  21.34 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0544  spore germination protein KC  21.41 
 
 
374 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4668  spore germination protein GerKC  21.45 
 
 
374 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0158  spore germination protein xc  30.33 
 
 
317 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4565  spore germination B3 GerAC family protein  26.72 
 
 
359 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>