299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_R0048 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_AR0032  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0020  tRNA-Pro  98.63 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.951008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0032  tRNA-Pro  96.72 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.601376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0011  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11857  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0032  tRNA-Pro  96.72 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0033  tRNA-Pro  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0043  tRNA-Pro  96.72 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0170855  normal  0.349798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0019  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0774  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0048  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255642  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0615  tRNA-Pro  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.394292  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0044  tRNA-Pro  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0026  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0043  tRNA-Pro  95.24 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390511  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09740  tRNA-Pro  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.843645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0029  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.396369  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t10  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0829003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0029  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0677736  normal  0.092097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0032  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00831776  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0030  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0037  tRNA-Pro  95.08 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0018  tRNA-Pro  95.08 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.12762 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15160  tRNA-Pro  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00584084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0039  tRNA-Pro  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.500451  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0012  tRNA-Pro  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4561  tRNA-Pro  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315757  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23920  tRNA-Pro  95.08 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106953  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06390  tRNA-Pro  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284201  normal  0.0452079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0021  tRNA-Pro  95.08 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0024  tRNA-Pro  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0559967  normal  0.0473979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0011  tRNA-Pro  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0035  tRNA-Pro  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0018  tRNA-Pro  95.08 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0024  tRNA-Pro  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0026  tRNA-Pro  95.08 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0023  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  0.736236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0034  tRNA-Pro  94.83 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.191079 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15480  tRNA-Pro  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.837894  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0039  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000294906  hitchhiker  0.000684327 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0033  tRNA-Pro  93.44 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0281324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0052  tRNA-Pro  90.41 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14021  tRNA-Pro  93.44 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0027  tRNA-Pro  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0711  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0039  tRNA-Pro  90.41 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000242706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0050  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0840957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0044  tRNA-Pro  90.41 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t08  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.657243  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0033  tRNA-Pro  93.1 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273821  hitchhiker  0.000950715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19810  tRNA-Pro  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0033  tRNA-Pro  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.981305 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0018  tRNA-Pro  89.04 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161643  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0053  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00100217  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0768  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.28458  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0032  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0031  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0616283  decreased coverage  0.00565268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0005  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0026  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122397  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0015  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0042  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.888445  hitchhiker  0.00955476 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0011  tRNA-Pro  95.65 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0097  tRNA-Pro  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.96402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0047  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.043428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0039  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0039  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0002  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0041  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.592302  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0032  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.832737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0590  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.532151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1702  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.535582  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4311  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0022  tRNA-Pro  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000263342  normal  0.454307 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0562  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.60431  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0035  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4244  normal  0.758764 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2759  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0341238  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1308  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.585322  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1407  tRNA-Pro  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00146012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0001  tRNA-Pro  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0052  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0051  tRNA-Pro  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0034  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1531  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.47488  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0024  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0008  tRNA-Pro  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152664  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1501  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.287153  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0039  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00372537  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0064  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0037  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448716  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0010  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.475805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0039  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1470  tRNA-Pro  90.16 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.203252  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0041  tRNA-Pro  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0071  tRNA-Pro  88.24 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000628165  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0002  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0042  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.716444  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0010  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0047  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>