34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0482 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0482  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  423  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2629  hypothetical protein  55.45 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1532  putative spermidine synthase  28.07 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.218383  normal  0.14893 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  30.36 
 
 		 516 aa  55.1  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  30.19 
 
 		 307 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  29.6 
 
 		 247 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  29.6 
 
 		 247 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  29.6 
 
 		 247 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  28.03 
 
 		 289 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  32.26 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  29.03 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  28.23 
 
 		 247 aa  48.5  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  28.8 
 
 		 247 aa  48.1  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  28.8 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  28.8 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  30.71 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  28.8 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  28.8 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  28.8 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  30 
 
 		 502 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1760  hypothetical protein  26.32 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  29.17 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  27.21 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  24.07 
 
 		 311 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  30.71 
 
 		 255 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 304 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  27.75 
 
 		 520 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  27.75 
 
 		 520 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  26.45 
 
 		 551 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  27.68 
 
 		 261 aa  42.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  28.57 
 
 		 277 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  29.11 
 
 		 304 aa  42  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  28.21 
 
 		 262 aa  42  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  28.95 
 
 		 520 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>