55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1916 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1916  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  523  1e-147  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1509  hypothetical protein  88.02 
 
 
320 aa  449  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.055753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1558  hypothetical protein  85.94 
 
 
316 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1015  hypothetical protein  85.54 
 
 
324 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1336  hypothetical protein  84.74 
 
 
316 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0991  hypothetical protein  73.02 
 
 
324 aa  384  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000745042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1034  hypothetical protein  72.22 
 
 
321 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.121952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0762  hypothetical protein  70.04 
 
 
317 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00138696  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0038  hypothetical protein  67.07 
 
 
324 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1243  hypothetical protein  63.82 
 
 
310 aa  314  7e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429592  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0686  hypothetical protein  61.38 
 
 
312 aa  308  4e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000261491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  54.89 
 
 
320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  52.77 
 
 
336 aa  267  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  52.77 
 
 
324 aa  263  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  53.62 
 
 
320 aa  261  6.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  49.36 
 
 
339 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4593  hypothetical protein  44.92 
 
 
311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00114736  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0198  hypothetical protein  43.83 
 
 
313 aa  215  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202809  hitchhiker  0.00402229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5125  hypothetical protein  43.27 
 
 
310 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2950  hypothetical protein  43.67 
 
 
334 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0249458  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1962  hypothetical protein  43.64 
 
 
327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2414  hypothetical protein  42.92 
 
 
307 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3938  hypothetical protein  42.49 
 
 
311 aa  198  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4532  hypothetical protein  41.81 
 
 
319 aa  198  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4493  hypothetical protein  41.81 
 
 
319 aa  198  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1061  hypothetical protein  42.86 
 
 
311 aa  191  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349 
 
 
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  40.25 
 
 
325 aa  182  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1739  hypothetical cytosolic protein  40.93 
 
 
312 aa  179  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  39.83 
 
 
325 aa  178  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1567a  hypothetical cytosolic protein  40.52 
 
 
335 aa  178  8e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.203402  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0619  hypothetical protein  40.09 
 
 
341 aa  176  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  47.13 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1399  hypothetical protein  44.6 
 
 
211 aa  135  9e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0266105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2345  hypothetical protein  48.8 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2348  hypothetical protein  47.2 
 
 
201 aa  122  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4692  hypothetical protein  35.21 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.824863  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3970  hypothetical protein  28.39 
 
 
317 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.257716  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  29 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0681  hypothetical protein  28.57 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000573749  unclonable  0.0000000126403 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  28.57 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1193  hypothetical protein  28.32 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1222  hypothetical protein  27.88 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0564  hypothetical protein  29.35 
 
 
302 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3368  hypothetical protein  28.39 
 
 
297 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2274  hypothetical protein  26.64 
 
 
315 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  25.53 
 
 
330 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  25.11 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1306  hypothetical protein  27.9 
 
 
283 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3206  hypothetical protein  26.61 
 
 
284 aa  52.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.488157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0748  hypothetical protein  27.78 
 
 
134 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000803284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1221  hypothetical protein  25.94 
 
 
292 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1182  hypothetical protein  26.36 
 
 
304 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3426  hypothetical protein  22.65 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2187  hypothetical protein  29.92 
 
 
290 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0655  hypothetical protein  25.63 
 
 
300 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>