23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8747 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8747  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 994 aa  1935    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0409  peptidoglycan-binding LysM  36.28 
 
 		 1385 aa  93.2  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.617719 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4651  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  32.93 
 
 		 1124 aa  86.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.839576 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4135  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1002 aa  85.9  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  29.72 
 
 		 1091 aa  83.2  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6300  hypothetical protein  36.82 
 
 		 1655 aa  82.4  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.633429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8210  hypothetical protein  39.51 
 
 		 1090 aa  78.2  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1313  hypothetical protein  36 
 
 		 969 aa  75.5  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0694  hypothetical protein  34.29 
 
 		 564 aa  74.3  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  27.41 
 
 		 1051 aa  72  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  26.26 
 
 		 1079 aa  68.2  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  50 
 
 		 935 aa  62.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  44.29 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  37.58 
 
 		 1066 aa  61.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3125  integral membrane protein  41.46 
 
 		 628 aa  60.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.435846  hitchhiker  0.000875177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2755  Peptidoglycan-binding LysM  37.36 
 
 		 1147 aa  55.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00369257  normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 		 304 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  23.93 
 
 		 1086 aa  50.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2587  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  46 
 
 		 992 aa  48.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1730  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  46 
 
 		 988 aa  47.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0938978  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0425  peptidoglycan-binding LysM  52.63 
 
 		 334 aa  47  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1611  peptidoglycan-binding LysM  52.63 
 
 		 334 aa  47  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000139366  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  54.55 
 
 		 190 aa  44.7  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>