More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7981 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7981  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
253 aa  507  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3584  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  68.9 
 
 
208 aa  287  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0417204  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0383  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  66.18 
 
 
202 aa  260  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4216  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.59 
 
 
217 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.298326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4198  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  64.42 
 
 
206 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0718234  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0659  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.86 
 
 
219 aa  250  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.48364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3807  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.73 
 
 
206 aa  246  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1247  putative phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61.95 
 
 
206 aa  242  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.378039  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6504  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  62.14 
 
 
211 aa  241  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04960  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.9 
 
 
205 aa  235  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0610  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.94 
 
 
213 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3013  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.85 
 
 
211 aa  225  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000892633  hitchhiker  0.00295616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28120  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.75 
 
 
228 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3965  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.68 
 
 
215 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2533  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.72 
 
 
218 aa  214  8e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272772  normal  0.391268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3996  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60 
 
 
198 aa  212  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00211251  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2573  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  60 
 
 
195 aa  209  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1164  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.93 
 
 
188 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000485336 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1088  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.45 
 
 
187 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1271  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.6 
 
 
208 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246325  normal  0.912887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.11 
 
 
209 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4320  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.11 
 
 
209 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802678  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4406  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.11 
 
 
209 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1366  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.91 
 
 
211 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0737  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.91 
 
 
213 aa  196  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.407866  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0677  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.8 
 
 
225 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.744174  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3305  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.33 
 
 
204 aa  191  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4857  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.02 
 
 
218 aa  188  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.178721  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10974  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.91 
 
 
215 aa  188  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0809236  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07800  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  52.45 
 
 
209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.463663  normal  0.355884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5974  phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase  50.77 
 
 
828 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0783963  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04480  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.55 
 
 
187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.49 
 
 
218 aa  178  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0142355 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0656  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.23 
 
 
216 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4420  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.45 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24110  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.08 
 
 
202 aa  170  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.12 
 
 
224 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.83 
 
 
215 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2693  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.83 
 
 
217 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.467272  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.29 
 
 
205 aa  159  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.95 
 
 
203 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.41 
 
 
205 aa  155  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1477  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.22 
 
 
200 aa  155  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.41 
 
 
205 aa  155  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.72 
 
 
204 aa  155  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.83 
 
 
205 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234419  normal  0.638022 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1673  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.67 
 
 
198 aa  153  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0568966 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.98 
 
 
205 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2835  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.12 
 
 
224 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.35 
 
 
206 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.38 
 
 
195 aa  152  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2993  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.56 
 
 
212 aa  152  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.16 
 
 
206 aa  151  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.38 
 
 
195 aa  151  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.79 
 
 
215 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0791  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.09 
 
 
220 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277928  normal  0.560587 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.86 
 
 
195 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.86 
 
 
195 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.86 
 
 
195 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.86 
 
 
195 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3378  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.89 
 
 
205 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.092004 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0913  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.05 
 
 
210 aa  149  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.42 
 
 
206 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.86 
 
 
195 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2577  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.05 
 
 
205 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829885  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.71 
 
 
204 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.57 
 
 
225 aa  148  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.34 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.2 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.71 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.57 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.93 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41 
 
 
212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2869  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.93 
 
 
212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.34 
 
 
195 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41 
 
 
212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45 
 
 
222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41 
 
 
212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.71 
 
 
211 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.67 
 
 
219 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.71 
 
 
223 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.05 
 
 
219 aa  146  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.58 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.61 
 
 
205 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.5 
 
 
213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04220  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  43.5 
 
 
212 aa  145  5e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.94 
 
 
222 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.25 
 
 
222 aa  145  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.9 
 
 
220 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1169  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.88 
 
 
212 aa  145  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.88 
 
 
212 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0278  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.79 
 
 
195 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2635  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.88 
 
 
212 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.41 
 
 
212 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02392  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.88 
 
 
212 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02354  hypothetical protein  41.88 
 
 
212 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.88 
 
 
212 aa  145  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.88 
 
 
212 aa  145  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.154299  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.52 
 
 
220 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.56 
 
 
229 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>