23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6726 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6726  hypothetical protein  100 
 
 		 580 aa  1173    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  32.02 
 
 		 839 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  26.88 
 
 		 801 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  28.79 
 
 		 722 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5098  hypothetical protein  29.95 
 
 		 788 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  27.22 
 
 		 627 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0539  hypothetical protein  29.22 
 
 		 648 aa  153  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5089  Parallel beta-helix repeat protein  29.24 
 
 		 791 aa  150  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.46946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  28.54 
 
 		 1011 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  25.18 
 
 		 832 aa  141  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  26.92 
 
 		 838 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  26.21 
 
 		 965 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  25.62 
 
 		 951 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  23.37 
 
 		 2286 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  28.4 
 
 		 1049 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.85 
 
 		 789 aa  84  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  24.23 
 
 		 677 aa  83.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5426  hypothetical protein  26.06 
 
 		 563 aa  81.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  22.56 
 
 		 708 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.8 
 
 		 644 aa  64.3  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  24.62 
 
 		 709 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1121 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  25 
 
 		 752 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>