70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6312 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6312  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III  100 
 
 		 315 aa  632  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1058  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  45.39 
 
 		 308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3097  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III  38.06 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3787  hypothetical protein  31.03 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0256847 
 
 
-
 
NC_003296  RS01921  hypothetical protein  25.75 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968131  hitchhiker  0.00589558 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1086  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  36.64 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1082  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.55 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.912749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4278  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  25.46 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  hitchhiker  0.00544084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4215  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  24.15 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508028 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0417  hypothetical protein  26.35 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0646  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.83 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10280  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  35 
 
 		 328 aa  53.1  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.057414 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3802  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  26.67 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3882  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  27.51 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.264087  normal  0.0481664 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4310  hypothetical protein  23.87 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1206  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  32.72 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1112  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  32.72 
 
 		 324 aa  49.7  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0132  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  27.72 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2017  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  25 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1326  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.47 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4272  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  26.07 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351964  hitchhiker  0.000234797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3809  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  25.88 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1001  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.88 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0148108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0982  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.88 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000366102  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3231  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.67 
 
 		 348 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4233  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  29.37 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2496  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.83 
 
 		 319 aa  46.2  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000027329  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0459  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.13 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0031  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.88 
 
 		 336 aa  45.8  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0645987  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1601  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.4 
 
 		 319 aa  45.8  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000117796  hitchhiker  0.000966367 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0177  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.62 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.991749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2502  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.06 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0775365 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1079  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.57 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2370  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  29.23 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.196696  normal  0.0307335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1605  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.18 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0641  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.57 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1121  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.57 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0534  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  30.58 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.211453  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1624  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.3 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0776516  normal  0.0214519 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0639  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  35.85 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000296079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5248  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.32 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.580515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4400  hypothetical protein  29.79 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.56 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0177097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3031  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  28.28 
 
 		 346 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.57 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.0499855 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0323  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.96 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2886  hypothetical protein  24.47 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2031  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.65 
 
 		 394 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3263  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25.13 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0130  hypothetical protein  24.47 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1458  hypothetical protein  24.47 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3160  hypothetical protein  24.47 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1784  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  30.43 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344205 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0710  hypothetical protein  24.47 
 
 		 332 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51410  PqsC  29.79 
 
 		 348 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000109894 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1523  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.93 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00187738  normal  0.904573 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0525  hypothetical protein  24.47 
 
 		 332 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0543  hypothetical protein  24.47 
 
 		 332 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2853  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.16 
 
 		 329 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.431701  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4399  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.56 
 
 		 337 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2366  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.55 
 
 		 355 aa  42.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116457  normal  0.112978 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2792  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.16 
 
 		 329 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2907  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.16 
 
 		 329 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.152596  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1896  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  26.47 
 
 		 332 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765527 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2731  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  26.9 
 
 		 332 aa  42.7  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0567  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  20.31 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0138  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  24.81 
 
 		 315 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0418  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  34.43 
 
 		 338 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09310  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.34 
 
 		 350 aa  42.4  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.400021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>