67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3922 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3922  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  100 
 
 		 346 aa  687    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0097  NLPA lipoprotein  31.05 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2222  taurine ABC transporter, periplasmic taurine-binding protein  31.2 
 
 		 336 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0622  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  31.2 
 
 		 336 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0123615  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2135  taurine ABC transporter, periplasmic taurine-binding protein  31.2 
 
 		 336 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.08 
 
 		 335 aa  53.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  26.38 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  24.74 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0800  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  23.66 
 
 		 349 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  26.39 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2964  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  28.85 
 
 		 340 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2330  NMT1/THI5 like domain-containing protein  26.34 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  22.71 
 
 		 349 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1920  NMT1/THI5 like domain protein  26.6 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  23.34 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0589  putative signal peptide protein  25.27 
 
 		 355 aa  50.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.66482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3124  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.77 
 
 		 362 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.45434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  22.85 
 
 		 336 aa  50.1  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.29 
 
 		 345 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0838  taurine transporter substrate binding subunit  27.88 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  23.94 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  24.54 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2477  NMT1/THI5 like domain protein  26.05 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  22.19 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2931  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.55 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1901  NMT1/THI5 like domain protein  25.09 
 
 		 353 aa  46.6  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2659  NMT1/THI5 like domain protein  27.54 
 
 		 324 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5981  ABC transporter substrate-binding protein  26.73 
 
 		 311 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0354  NMT1/THI5 like domain protein  23.14 
 
 		 316 aa  46.6  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8277  ABC transport system substrate-binding protein  25.88 
 
 		 336 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0627957 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.21 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2664  alkanesulfonates-binding protein  24.52 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.55 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  27.69 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  24.57 
 
 		 407 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0049  putative nitrate transport protein NrtA  25.49 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4035  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  29.38 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3267  taurine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.92 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1035  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  25.52 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2720  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  25.09 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.13 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23.66 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  24.05 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5599  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.83 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0117  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.55 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  27.52 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1743  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  24.66 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00139756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.45 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0041  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.46 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.487407 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  23.66 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0619  NMT1/THI5 like domain protein  24.77 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  23.66 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44550  ABC transporter periplasmic component  25.75 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0844  ABC transporter substrate-binding protein  23.12 
 
 		 345 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  23.21 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.04 
 
 		 335 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  24.04 
 
 		 335 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3087  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.19 
 
 		 354 aa  43.1  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0286269 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.17 
 
 		 335 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12920  taurine ABC transporter periplasmic protein  24.8 
 
 		 337 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.472759  normal  0.43236 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0053  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.35 
 
 		 334 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>