22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3339 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3339  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  583  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.63236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1712  hypothetical protein  46.75 
 
 
324 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514921  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0922  hypothetical protein  51.1 
 
 
329 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2245  hypothetical protein  42.8 
 
 
399 aa  195  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  0.0195881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1912  hypothetical protein  43.33 
 
 
334 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.225812  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16050  hypothetical protein  43.41 
 
 
379 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3818  integral membrane protein  36.73 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75139  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0484  hypothetical protein  32.56 
 
 
732 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2727  hypothetical protein  35.89 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.173585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4243  hypothetical protein  36.06 
 
 
286 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.588596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6439  putative RNA-binding protein  35.89 
 
 
419 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.351487  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1796  hypothetical protein  32.98 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0792  hypothetical protein  32.03 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3731  hypothetical protein  32.23 
 
 
364 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0115  hypothetical protein  32.03 
 
 
394 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5336  hypothetical protein  32.09 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06070  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.908677  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.73 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08786  conserved hypothetical protein  29.19 
 
 
322 aa  79  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.616918 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0185  hypothetical protein  31.25 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  0.0977063 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01465  integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04560)  26.79 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0667583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.83 
 
 
359 aa  42.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.66002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>