19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3022 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3022  putative outer membrane protein  100 
 
 		 170 aa  332  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  33.53 
 
 		 404 aa  61.2  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  29.78 
 
 		 387 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2709  OmpA-like transmembrane region  31.75 
 
 		 200 aa  48.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.103983  normal  0.0521155 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  25.62 
 
 		 376 aa  48.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2541  OmpA domain-containing protein  30.84 
 
 		 196 aa  47.8  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.480511 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  24.38 
 
 		 373 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4473  outer membrane protein, putative  25 
 
 		 188 aa  44.3  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  27.86 
 
 		 373 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05474  hypothetical protein  34.71 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0734  OmpA domain-containing protein  31.07 
 
 		 191 aa  41.2  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3691  OmpA domain-containing protein  25.75 
 
 		 192 aa  41.2  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4651  putative outer membrane protein  31.53 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0980959  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  22.54 
 
 		 372 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  22.54 
 
 		 372 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  21.21 
 
 		 373 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3765  OmpA domain-containing protein  22.84 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.301478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0256  OmpA domain-containing protein  22.84 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.000341741 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  26.43 
 
 		 367 aa  40.8  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>