32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1821 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1821  acyltransferase family protein  100 
 
 		 412 aa  832    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3053  hypothetical protein  31.83 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5068  acyltransferase family protein  31.17 
 
 		 419 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4114  acyltransferase family protein  29.29 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2406  acyltransferase 3  27.06 
 
 		 395 aa  172  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3626  acyltransferase 3  30.07 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635249  hitchhiker  0.00443185 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1821  hypothetical protein  31.51 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.190924  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3423  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  27.59 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1853  hypothetical protein  28.91 
 
 		 384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3623  inner membrane protein  28.32 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0756  acyltransferase family protein  27.04 
 
 		 390 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494217  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  27.46 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3503  acyltransferase 3  22.28 
 
 		 407 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0352  acyltransferase family protein  26.29 
 
 		 399 aa  100  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3591  acyltransferase 3  22.3 
 
 		 407 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3660  acyltransferase 3  20.96 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01350  hypothetical protein  25.08 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01051  hypothetical protein  24.05 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.324089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2598  acyltransferase 3  24.05 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01044  glucans biosynthesis protein  24.05 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2084  glucans biosynthesis protein  24.05 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.72315  normal  0.86966 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2552  glucans biosynthesis protein  24.05 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170085  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1168  glucans biosynthesis protein  24.05 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0460128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1563  glucans biosynthesis protein  22.75 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0264724  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1427  glucans biosynthesis protein  24.05 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.379852 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1167  glucans biosynthesis protein  24.05 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193377  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2284  glucans biosynthesis protein  24.05 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624965  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1245  glucans biosynthesis protein  22.03 
 
 		 384 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1216  glucans biosynthesis protein  22.03 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.844571  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1260  glucans biosynthesis protein  22.03 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2224  glucans biosynthesis protein  21.97 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2040  glucans biosynthesis protein  21.97 
 
 		 384 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000145807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>