More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1683 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  100 
 
 
476 aa  964    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  98.02 
 
 
476 aa  904    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  43.69 
 
 
485 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.77 
 
 
482 aa  434  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  44.35 
 
 
488 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  44.96 
 
 
494 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.42 
 
 
472 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  44.96 
 
 
494 aa  412  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  43.42 
 
 
477 aa  412  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  41.58 
 
 
490 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  41.07 
 
 
499 aa  392  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  41.32 
 
 
490 aa  382  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  41.42 
 
 
505 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  41.42 
 
 
505 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  40.12 
 
 
514 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  39.71 
 
 
514 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  39.71 
 
 
514 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  39.71 
 
 
514 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  39.71 
 
 
514 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  39.71 
 
 
514 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  39.71 
 
 
514 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  39.71 
 
 
514 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  40.62 
 
 
483 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  40.41 
 
 
483 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  38.38 
 
 
487 aa  364  1e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  39.5 
 
 
514 aa  364  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  38.82 
 
 
502 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  39.38 
 
 
514 aa  361  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  40.21 
 
 
484 aa  361  2e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  38.97 
 
 
502 aa  360  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  38.46 
 
 
481 aa  359  5e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  39.09 
 
 
514 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  39.18 
 
 
509 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  38.68 
 
 
509 aa  351  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.5 
 
 
541 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  38.7 
 
 
509 aa  351  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  38.68 
 
 
509 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  38.7 
 
 
509 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  38.21 
 
 
495 aa  351  2e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  38.7 
 
 
509 aa  350  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  38.7 
 
 
509 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  38.7 
 
 
509 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  39.14 
 
 
509 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  38.73 
 
 
509 aa  345  8e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  37.61 
 
 
480 aa  345  8e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.96 
 
 
486 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1793  phospholipase D/transphosphatidylase  38.64 
 
 
497 aa  343  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1387  cardiolipin synthetase 2  36.94 
 
 
477 aa  331  2e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.57 
 
 
508 aa  330  3e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  37.5 
 
 
483 aa  329  6e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  40.29 
 
 
470 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.32 
 
 
483 aa  318  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0911  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.05 
 
 
485 aa  315  9e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000528236 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0093  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  36.85 
 
 
463 aa  315  9.999999999999999e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.03 
 
 
485 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2322  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.13 
 
 
498 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.822451  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.34 
 
 
478 aa  310  5e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.54 
 
 
526 aa  301  1e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  34.91 
 
 
473 aa  295  8e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  37.45 
 
 
486 aa  293  4e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.38 
 
 
492 aa  289  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  33.41 
 
 
478 aa  272  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.84 
 
 
481 aa  272  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.85 
 
 
477 aa  270  4e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  31.04 
 
 
478 aa  269  8e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  31.68 
 
 
484 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3455  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.08 
 
 
396 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  30.5 
 
 
479 aa  259  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  29.59 
 
 
481 aa  259  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3346  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.73 
 
 
395 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000729556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0354  cardiolipin synthetase  34.71 
 
 
511 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00517773  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.14 
 
 
490 aa  256  9e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0345  cardiolipin synthetase  33.68 
 
 
511 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  29.51 
 
 
479 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  30.77 
 
 
474 aa  253  7e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  29.36 
 
 
479 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.19 
 
 
486 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  31.09 
 
 
490 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  30.87 
 
 
491 aa  250  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0222  putative cardiolipin synthetase  30.14 
 
 
497 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  30.02 
 
 
477 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2057  cardiolipin synthetase 2  32.82 
 
 
486 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.830575  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  30.02 
 
 
477 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  29.76 
 
 
479 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  29.26 
 
 
483 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.77 
 
 
486 aa  248  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  29.42 
 
 
481 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  31.21 
 
 
490 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  35.92 
 
 
441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  31.34 
 
 
486 aa  246  9e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  30.79 
 
 
505 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  29.11 
 
 
489 aa  244  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  29.5 
 
 
479 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  37.12 
 
 
397 aa  243  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  27.97 
 
 
483 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  31.5 
 
 
492 aa  239  8e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  27.83 
 
 
481 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  29.07 
 
 
479 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  28.87 
 
 
478 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5477  cardiolipin synthetase domain-containing protein  34.63 
 
 
397 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>