More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1193 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1193  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 306 aa  599  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00148533  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1021  ABC transporter, ATP-binding protein  97.71 
 
 		 306 aa  547  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00236581  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2323  ABC transporter related  46.2 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  47.04 
 
 		 307 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  45.54 
 
 		 306 aa  263  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2294  ABC transporter related  42.33 
 
 		 306 aa  257  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4648  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 307 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0359  ABC transporter related  44.3 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.3561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4270  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 307 aa  249  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.071906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4431  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  44.22 
 
 		 307 aa  248  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4774  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  44.22 
 
 		 307 aa  248  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4363  ABC transporter related  43.56 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  45.6 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4661  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 307 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0592  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4660  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4281  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4645  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1721  ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.847764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 		 309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  44.3 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  44.3 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  44.3 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 		 309 aa  242  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  45 
 
 		 318 aa  242  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  44.04 
 
 		 309 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3948  ABC transporter related  43.6 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3231  ABC transporter-related protein  42.24 
 
 		 312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0683  ABC transporter related  36.57 
 
 		 316 aa  231  9e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  39.12 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.33 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  39.93 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  37.58 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  37.99 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  39.22 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  38.94 
 
 		 303 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  37.01 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  36.6 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  37.01 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  36.69 
 
 		 305 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  37.58 
 
 		 304 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 		 305 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  36.36 
 
 		 305 aa  202  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  37.42 
 
 		 303 aa  201  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  39.6 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  36.39 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.39 
 
 		 331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  36.27 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  37.42 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  36.39 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  36.27 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  36.39 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  37.93 
 
 		 301 aa  199  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.39 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4010  ABC transporter related protein  36.69 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2125  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  36.42 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  39.34 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  37.17 
 
 		 304 aa  196  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0642  ABC transporter related  39 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0145806  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  34.81 
 
 		 318 aa  192  8e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1438  ABC transporter, ATPase subunit  36.57 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.87 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  35.91 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  35.81 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  32.55 
 
 		 326 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2202  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.43 
 
 		 341 aa  186  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  37.95 
 
 		 302 aa  186  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  37.87 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  34.3 
 
 		 309 aa  182  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  34.46 
 
 		 311 aa  182  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  34.43 
 
 		 326 aa  179  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03750  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.6 
 
 		 237 aa  178  8e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.591537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  34.74 
 
 		 300 aa  178  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  32.48 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  34.74 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  33.87 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  34.74 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  34.74 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  34.74 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1167  ABC transporter related  41.67 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  0.478862 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  35.62 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  33.33 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  34.74 
 
 		 300 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0156  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  43.48 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  35.28 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.32 
 
 		 329 aa  175  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2338  ABC transporter-like protein  38.21 
 
 		 305 aa  175  9e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  34.52 
 
 		 300 aa  175  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7061  ABC transporter related  33.44 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  33.23 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  34.67 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  32.52 
 
 		 347 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0916  ABC transporter related protein  35.37 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0694258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  33.89 
 
 		 304 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>