18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL06350 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL06350  RNA cap binding protein, putative  100 
 
 		 135 aa  271  3e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68190  predicted protein  31.9 
 
 		 166 aa  89.4  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.502273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39384  predicted protein  37.21 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.447648  normal  0.30848 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50048  predicted protein  33.59 
 
 		 225 aa  70.9  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.339546  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32889  predicted protein  37.33 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14893  predicted protein  34.67 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160783  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.84 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05400  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm8, putative  34.25 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10752  predicted protein  32.81 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  36.84 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  30 
 
 		 131 aa  43.9  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  35.53 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42488  predicted protein  28.89 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.357284  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35063  predicted protein  31.71 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02650  conserved hypothetical protein  29.49 
 
 		 195 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0190599  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  34.21 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.92 
 
 		 73 aa  40  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01495  small nuclear ribonucleoprotein SmG, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04960)  34.78 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>