31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK00910 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK00910  tbc1 domain family protein, putative  100 
 
 
598 aa  1230    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85276  predicted protein  43.22 
 
 
507 aa  338  9.999999999999999e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07444  GTPase activating protein (Gyp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06080)  60.14 
 
 
523 aa  327  3e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000566047  normal  0.90636 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12157  predicted protein  45.59 
 
 
330 aa  298  2e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2527  predicted protein  26.84 
 
 
333 aa  105  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23532  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02160  conserved hypothetical protein  23.62 
 
 
860 aa  83.6  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06618  GTPase activating protein (Gyp7), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03940)  24.39 
 
 
817 aa  83.2  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.472998 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28778  predicted protein  22.15 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00481589  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00320  Rab GTPase activator, putative  26.21 
 
 
897 aa  80.5  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0237243  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26794  predicted protein  24.67 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.649939  normal  0.0260898 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01000  conserved hypothetical protein  23.81 
 
 
644 aa  67  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0847196  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10355  GTPase activating protein (Gyp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12870)  22.69 
 
 
845 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000127228  normal  0.582119 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02790  expressed protein  33.96 
 
 
393 aa  62.4  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84608  GTPase activating protein  24.22 
 
 
774 aa  60.1  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.323048 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5426  predicted protein  24.55 
 
 
230 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0224644  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00620  Rab GTPase activator, putative  26.87 
 
 
1137 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00573  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11220)  20.58 
 
 
1076 aa  58.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.456943  normal  0.0468183 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85359  predicted protein  19.76 
 
 
641 aa  57.8  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0278738  normal  0.155514 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01980  GTPase activating protein (Gyp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10600)  23.53 
 
 
883 aa  57.4  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0011064 
 
 
-
 
NC_006686  CND01110  conserved hypothetical protein  23.81 
 
 
1051 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10479  predicted protein  24.04 
 
 
300 aa  56.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01510  mic1-like protein, putative  23.27 
 
 
1053 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04537  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02840)  24.76 
 
 
684 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236302  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04290  GTPase activating protein, putative  22.06 
 
 
647 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16235  predicted protein  25.58 
 
 
440 aa  52  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_55114  predicted protein  24.11 
 
 
617 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.950731  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86304  GTPase activating protein (GAP)  20.08 
 
 
938 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.500519 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03094  TBC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12470)  24.34 
 
 
824 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.467461  normal  0.746893 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82544  predicted protein  29.57 
 
 
558 aa  45.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30439  predicted protein  24 
 
 
940 aa  44.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0509505 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11010  GTPase activating protein (Gyp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07440)  21.97 
 
 
1120 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.988868 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>