33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH03830 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006693  CNH03830  clathrin binding protein, putative  100 
 
 		 755 aa  1539    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03029  AP-1 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08970)  53.59 
 
 		 766 aa  785    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0965274 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03830  clathrin binding protein, putative  96.82 
 
 		 732 aa  1414    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74268  beta-adaptin, large subunit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex  46.54 
 
 		 736 aa  605  9.999999999999999e-173  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04170  vesicle-mediated transport-related protein, putative  48.65 
 
 		 696 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.567808  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119607  Beta adaptin-like protein  47.94 
 
 		 551 aa  538  1e-151  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05950  AP-2 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10340)  43.52 
 
 		 717 aa  523  1e-147  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84899  predicted protein  35.93 
 
 		 697 aa  379  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54730  predicted protein  30.26 
 
 		 805 aa  282  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.442884  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86921  predicted protein  29.29 
 
 		 785 aa  261  3e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44118  predicted protein  29.21 
 
 		 676 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.139737  normal  0.0310937 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00165  AP-3 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11360)  27.04 
 
 		 841 aa  178  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.318304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06410  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  24.45 
 
 		 835 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_54789  predicted protein  24.48 
 
 		 1205 aa  127  9e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88879  clathrin assembly complex beta adaptin component  24.49 
 
 		 817 aa  117  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.789212 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91200  predicted protein  21.33 
 
 		 947 aa  73.2  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42302  predicted protein  21.75 
 
 		 622 aa  69.7  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110936  hitchhiker  0.00027641 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49385  predicted protein  20.7 
 
 		 936 aa  65.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0497486  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04207  AP-1 adaptor complex subunit gamma, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06030)  21.01 
 
 		 839 aa  65.1  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02780  ER to Golgi transport-related protein, putative  19.28 
 
 		 952 aa  63.9  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346474  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01177  Coatomer subunit beta, putative (Eurofung)  28.5 
 
 		 950 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.49 
 
 		 395 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  26.49 
 
 		 395 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01870  gamma-adaptin, putative  22.16 
 
 		 854 aa  50.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.543816  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54028  predicted protein  19.56 
 
 		 1277 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.214816  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44719  predicted protein  23.84 
 
 		 895 aa  48.5  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00567496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74925  coatomer gamma non-clathrin coat protein involved in transport between ER and Golgi  20.15 
 
 		 935 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0538338  normal  0.0907114 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08291  AP-3 complex subunit delta, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03640)  26.56 
 
 		 934 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.258771  hitchhiker  0.0000000134894 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00660  vesicle-mediated transport-related protein, putative  20 
 
 		 1063 aa  45.8  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04547  Coatomer subunit gamma, putative (Eurofung)  20.62 
 
 		 917 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152714  normal  0.168671 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54511  predicted protein  35.06 
 
 		 978 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39338  predicted protein  22.69 
 
 		 630 aa  44.3  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109278  normal  0.0495163 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13511  predicted protein  20.94 
 
 		 939 aa  44.3  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>