27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND05870 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND05870  conserved hypothetical protein  100 
 
 
1858 aa  3864    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08211  PHD transcription factor (Rum1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03430)  33.53 
 
 
1717 aa  707    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362779  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88926  conserved hypothetical protein DNA-binding protein jumonji/RBP2/SMCY, contains JmjC domain  41.06 
 
 
844 aa  278  5e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.492923  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19230  predicted protein  26.18 
 
 
1544 aa  256  3e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00281974 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17878  predicted protein  26.18 
 
 
1544 aa  256  3e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0363694 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32976  predicted protein  32.71 
 
 
1194 aa  244  7.999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.878376  normal  0.932901 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48747  predicted protein  35.64 
 
 
667 aa  231  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30668  predicted protein  32.85 
 
 
550 aa  226  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85882  protein involved in cell wall biogenesis and architecture  22.4 
 
 
1699 aa  147  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.134304 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02640  specific transcriptional repressor, putative  34.3 
 
 
1131 aa  125  7e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.430666  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48109  predicted protein  28.57 
 
 
857 aa  122  7e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86017  predicted protein  31.86 
 
 
654 aa  121  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01060  histone demethylase (Eurofung)  38.71 
 
 
1405 aa  114  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.135287  normal  0.0812629 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45954  predicted protein  52.94 
 
 
1041 aa  70.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340544  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42822  predicted protein  44.44 
 
 
837 aa  61.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119675  TrxG-related PHD-finger protein  47.92 
 
 
705 aa  60.1  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00240  conserved hypothetical protein  46.94 
 
 
940 aa  59.7  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0793418  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02340  conserved hypothetical protein  44.9 
 
 
518 aa  56.2  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14985  hypothetical protein, contains no bromo domain  44.9 
 
 
1474 aa  55.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25099  predicted protein  27.44 
 
 
729 aa  53.9  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42820  predicted protein  40 
 
 
419 aa  53.5  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749474  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01970  nucleus protein, putative  42 
 
 
511 aa  51.6  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18155  predicted protein  38.98 
 
 
444 aa  49.3  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.143202 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43759  predicted protein  32.79 
 
 
462 aa  47.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15230  predicted protein  44.68 
 
 
784 aa  48.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.456459  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07294  PHD and RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16870)  45.65 
 
 
614 aa  48.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0466722 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07300  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16810)  25.89 
 
 
841 aa  47  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.202225  normal  0.238789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>