21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND04940 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND04940  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  627  1e-179  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.189992  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32283  Exosome complex exonuclease RRP46 (Ribosomal RNA processing protein 46)  40.22 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0605509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  29.18 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  33.04 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  24.65 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  32.06 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  32.17 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  22.84 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  32.74 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16766  predicted protein  35.2 
 
 		 140 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.614591  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  32.5 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  40.62 
 
 		 245 aa  52.8  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  30.43 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  23.53 
 
 		 501 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  26.12 
 
 		 343 aa  49.3  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  28.47 
 
 		 244 aa  46.6  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  47.06 
 
 		 252 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  47.06 
 
 		 252 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  48.89 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2030  ribonuclease PH  44.68 
 
 		 244 aa  42.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3656  ribonuclease PH  48.89 
 
 		 250 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00626897  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>