29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND02090 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND02090  expressed protein  100 
 
 		 313 aa  648    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.841584  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05409  conserved hypothetical protein  25.99 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.172063 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28888  predicted protein  24.8 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.760508  normal  0.324549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  28.74 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00019  carnitine acetyl transferase (AFU_orthologue; AFUA_2G12530)  24.61 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.59 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 		 295 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.64 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  23.15 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.67 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.98 
 
 		 291 aa  46.2  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  19.26 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  19.26 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  19.26 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  19.26 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 		 194 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521962  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 		 424 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0560564  normal  0.509097 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.78 
 
 		 301 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>