21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC00420 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC00420  hypothetical protein  100 
 
 
477 aa  974    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136325  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1594  hypothetical protein  27 
 
 
461 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00372727  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0920  Methyltransferase type 12  30.25 
 
 
535 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5515  Methyltransferase type 12  29.25 
 
 
511 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1722  Methyltransferase type 12  28.36 
 
 
474 aa  93.2  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2985  methyltransferase type 12  29.36 
 
 
460 aa  90.9  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3501  Methyltransferase type 12  30.64 
 
 
455 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280234  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3132  Methyltransferase type 12  30.21 
 
 
494 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.058423  hitchhiker  0.0000598488 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1976  methyltransferase type 12  28.81 
 
 
465 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.019973  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4015  methyltransferase type 12  27.95 
 
 
534 aa  87.4  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.20547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6753  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  28.09 
 
 
504 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3284  Methyltransferase type 12  25.09 
 
 
465 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3745  hypothetical protein  31.56 
 
 
459 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946661  normal  0.0367829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0482  Methyltransferase type 12  27.31 
 
 
470 aa  82.8  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0171  methyltransferase type 12  28.93 
 
 
469 aa  82.8  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.738928  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37640  methyltransferase family protein  27 
 
 
524 aa  77.4  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0943  Methyltransferase type 12  24.68 
 
 
468 aa  75.1  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3568  methyltransferase type 12  27.1 
 
 
202 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00317327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1194  Methyltransferase type 12  32.06 
 
 
480 aa  73.6  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268598  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2767  methyltransferase type 12  25 
 
 
465 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2391  Methyltransferase type 12  26.38 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>