49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03920 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB03920  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 1284 aa  2642    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568739  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02073  BTB domain and ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04760)  26.44 
 
 		 1680 aa  320  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.768919 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51473  predicted protein  23.33 
 
 		 1448 aa  149  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  26.61 
 
 		 778 aa  69.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  27.45 
 
 		 784 aa  63.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  32.48 
 
 		 1312 aa  63.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.98 
 
 		 1848 aa  62  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  26.25 
 
 		 1187 aa  59.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.9 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  33.64 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.1 
 
 		 1147 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  23.88 
 
 		 792 aa  57.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  26.84 
 
 		 341 aa  55.5  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  35.61 
 
 		 727 aa  54.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15387  predicted protein  27.39 
 
 		 337 aa  54.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0420913  normal  0.0983623 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39304  predicted protein  29.02 
 
 		 394 aa  53.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.635663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  28.16 
 
 		 776 aa  53.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  24.78 
 
 		 1207 aa  52.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  33.03 
 
 		 544 aa  52.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  27.55 
 
 		 450 aa  51.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  30.33 
 
 		 593 aa  51.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.06 
 
 		 417 aa  51.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.06 
 
 		 567 aa  51.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  24.54 
 
 		 535 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  34.23 
 
 		 553 aa  49.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 449 aa  49.3  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  32.38 
 
 		 558 aa  48.9  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  31.9 
 
 		 558 aa  48.9  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  43.48 
 
 		 577 aa  48.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  32.84 
 
 		 743 aa  48.5  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  31.45 
 
 		 546 aa  47.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  25.76 
 
 		 941 aa  48.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 2082 aa  47.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  30.86 
 
 		 375 aa  47.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  24.5 
 
 		 737 aa  47  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  24.72 
 
 		 618 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  25.89 
 
 		 787 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  31.18 
 
 		 371 aa  47  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  28.64 
 
 		 551 aa  47.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  28.18 
 
 		 579 aa  47.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  25.95 
 
 		 363 aa  46.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  57.58 
 
 		 555 aa  47  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  25.95 
 
 		 363 aa  46.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  35.16 
 
 		 326 aa  46.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  27.6 
 
 		 602 aa  45.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.08 
 
 		 817 aa  45.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.67 
 
 		 570 aa  45.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  25.59 
 
 		 726 aa  45.1  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 447 aa  45.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>