27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA06840 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00327  RuvB-like helicase 2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGK3]  64.33 
 
 
468 aa  636    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06840  conserved hypothetical protein  100 
 
 
463 aa  945    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247034  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29898  transcriptional regulator  68.45 
 
 
484 aa  639    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.287738  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43499  predicted protein  65.49 
 
 
462 aa  628  1e-179  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50825  predicted protein  59.06 
 
 
451 aa  546  1e-154  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0862  TIP49-like  45.33 
 
 
441 aa  367  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00990  RVB1, putative  42.83 
 
 
484 aa  363  3e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0715  TIP49 domain-containing protein  42.99 
 
 
451 aa  350  3e-95  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2236  TIP49-like protein  42.63 
 
 
450 aa  350  3e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.385068 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1220  TIP49 domain protein  43.12 
 
 
448 aa  349  5e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.478544  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37582  RUVB-like protein  41.3 
 
 
459 aa  349  6e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0616  TBP-interacting protein TIP49  42.53 
 
 
450 aa  349  7e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1694  TIP49-like protein  41.95 
 
 
451 aa  347  2e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19568  predicted protein  42.03 
 
 
485 aa  345  7e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.921701  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01971  RuvB-like helicase 1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBV9]  40.97 
 
 
458 aa  343  4e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000052606  hitchhiker  0.00951448 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31398  predicted protein  40.77 
 
 
455 aa  341  1e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556143  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0596  TBP-interacting protein TIP49  42.07 
 
 
452 aa  340  4e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.739423 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0253  TIP49 domain protein  44.22 
 
 
452 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.632673  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0904  TIP49-like protein  40.41 
 
 
456 aa  330  2e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175331  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  37.31 
 
 
371 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  34.18 
 
 
372 aa  47.8  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  35.82 
 
 
371 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl403  recombination factor protein RarA  27.01 
 
 
410 aa  46.6  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1826  deoxynucleoside kinase family protein  28.19 
 
 
213 aa  44.3  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  33.68 
 
 
423 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0648  AAA ATPase central domain protein  38.46 
 
 
585 aa  43.9  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  29.52 
 
 
371 aa  43.5  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>