18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA02090 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA02090  vesicle-associated membrane protein 712, putative  100 
 
 		 306 aa  635    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17683  predicted protein  38.12 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32248  predicted protein  37.27 
 
 		 215 aa  141  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.672355  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00571  synaptobrevin/VAMP-like protein (Eurofung)  38.89 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0440913 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45601  predicted protein  31.46 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29604  predicted protein  27.22 
 
 		 227 aa  72.4  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03510  v-SNARE, putative  45.12 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08769  Putative synaptobrevin homologue SNC1/2 (Eurofung)  57.69 
 
 		 117 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251703  normal  0.0670162 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64252  predicted protein  24.86 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.823304  normal  0.145167 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41744  predicted protein  29.41 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00440664  normal  0.343781 
 
 
-
 
NC_006686  CND03150  hypothetical protein  23.31 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40152  Synaptobrevin/VAMP-like protein  45 
 
 		 111 aa  61.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.480151 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54066  predicted protein  21.71 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478736  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65879  predicted protein  25.2 
 
 		 200 aa  58.5  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0223662 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_51073  predicted protein  29.13 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00798092  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14089  predicted protein  27.66 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00970  conserved hypothetical protein  31.94 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.531752  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08488  Putative synaptobrevin YKT6 (Eurofung)  28.1 
 
 		 197 aa  50.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.481163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>