15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51073 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_51073  predicted protein  100 
 
 
200 aa  415  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00798092  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65879  predicted protein  45.77 
 
 
200 aa  204  1e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0223662 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14089  predicted protein  47.09 
 
 
206 aa  192  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08488  Putative synaptobrevin YKT6 (Eurofung)  44.78 
 
 
197 aa  169  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.481163  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00970  conserved hypothetical protein  44.55 
 
 
233 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.531752  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29604  predicted protein  26.88 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54066  predicted protein  27.81 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478736  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02090  vesicle-associated membrane protein 712, putative  29.13 
 
 
306 aa  57.8  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32248  predicted protein  28.79 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.672355  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03150  hypothetical protein  25.17 
 
 
224 aa  55.1  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64252  predicted protein  25.81 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.823304  normal  0.145167 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03510  v-SNARE, putative  37.29 
 
 
120 aa  46.2  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16798  predicted protein  26.27 
 
 
157 aa  46.2  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00571  synaptobrevin/VAMP-like protein (Eurofung)  34.48 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0440913 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17683  predicted protein  23.57 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>