15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH03510 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH03510  v-SNARE, putative  100 
 
 
120 aa  244  2e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08769  Putative synaptobrevin homologue SNC1/2 (Eurofung)  65.98 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251703  normal  0.0670162 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40152  Synaptobrevin/VAMP-like protein  60.42 
 
 
111 aa  119  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.480151 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02090  vesicle-associated membrane protein 712, putative  45.12 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32248  predicted protein  29.03 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.672355  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17683  predicted protein  38.27 
 
 
226 aa  59.3  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41744  predicted protein  30.43 
 
 
219 aa  58.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00440664  normal  0.343781 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00571  synaptobrevin/VAMP-like protein (Eurofung)  44.44 
 
 
263 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0440913 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65879  predicted protein  36.21 
 
 
200 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0223662 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_51073  predicted protein  37.29 
 
 
200 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00798092  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45601  predicted protein  26.32 
 
 
274 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00970  conserved hypothetical protein  33.93 
 
 
233 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.531752  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48591  predicted protein  26.14 
 
 
276 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684444  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14089  predicted protein  39.62 
 
 
206 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16798  predicted protein  33.85 
 
 
157 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>