17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_17683 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_17683  predicted protein  100 
 
 		 226 aa  473  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02090  vesicle-associated membrane protein 712, putative  38.12 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32248  predicted protein  36.92 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.672355  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00571  synaptobrevin/VAMP-like protein (Eurofung)  32.06 
 
 		 263 aa  90.9  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0440913 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45601  predicted protein  25 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41744  predicted protein  35.58 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00440664  normal  0.343781 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29604  predicted protein  26.51 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16798  predicted protein  30.83 
 
 		 157 aa  62  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64252  predicted protein  23.46 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.823304  normal  0.145167 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03510  v-SNARE, putative  39.68 
 
 		 120 aa  51.6  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40152  Synaptobrevin/VAMP-like protein  34.21 
 
 		 111 aa  50.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.480151 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65879  predicted protein  27.34 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0223662 
 
 
-
 
NC_006686  CND03150  hypothetical protein  17.07 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54066  predicted protein  20.23 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478736  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08769  Putative synaptobrevin homologue SNC1/2 (Eurofung)  31.17 
 
 		 117 aa  45.4  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251703  normal  0.0670162 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_51073  predicted protein  23.57 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00798092  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00970  conserved hypothetical protein  35.19 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.531752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>