14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_65879 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_65879  predicted protein  100 
 
 
200 aa  414  9.999999999999999e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0223662 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00970  conserved hypothetical protein  47.64 
 
 
233 aa  215  4e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.531752  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08488  Putative synaptobrevin YKT6 (Eurofung)  51.49 
 
 
197 aa  206  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.481163  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_51073  predicted protein  45.77 
 
 
200 aa  204  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00798092  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14089  predicted protein  44.44 
 
 
206 aa  184  8e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02090  vesicle-associated membrane protein 712, putative  25.2 
 
 
306 aa  58.2  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32248  predicted protein  27.74 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.672355  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00571  synaptobrevin/VAMP-like protein (Eurofung)  25.23 
 
 
263 aa  54.7  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0440913 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64252  predicted protein  28.1 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.823304  normal  0.145167 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29604  predicted protein  22.14 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17683  predicted protein  27.34 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03510  v-SNARE, putative  36.84 
 
 
120 aa  46.6  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54066  predicted protein  26.52 
 
 
227 aa  46.6  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478736  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2695  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  31.87 
 
 
453 aa  42.4  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0450627  normal  0.5058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>